More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3941 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  100 
 
 		 237 aa  488  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  78.9 
 
 		 237 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  37 
 
 		 1106 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.24 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  32.66 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  37.61 
 
 		 710 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 279 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  24.14 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.48 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.9 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  28.98 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  22.93 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  37.61 
 
 		 711 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  28.26 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.85 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 		 1032 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 237 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  35.58 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.73 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  31.03 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0317  Methyltransferase type 12  33.6 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.83 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.5 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  31.3 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  35 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.34 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2303  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0543227  normal  0.375483 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.73 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  25.12 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.69 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  22.84 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0585  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2219  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156175  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0954  Methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  29.1 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.69 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.75 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.12 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.51 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 634 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.94 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.31 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  32.98 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  29.92 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.57 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  28.82 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>