More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0994 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 
282 aa  584  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  54.63 
 
 
208 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  43.32 
 
 
295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  42.81 
 
 
295 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  39.57 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
271 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
274 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  37.91 
 
 
382 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
278 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
282 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.44 
 
 
261 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  33.92 
 
 
283 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  34.97 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  36.42 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  26.32 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 
328 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  33.93 
 
 
392 aa  93.6  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
279 aa  92  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  32.9 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.58 
 
 
330 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  26.88 
 
 
310 aa  90.1  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
284 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  33.12 
 
 
304 aa  89.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  31.76 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  30.89 
 
 
300 aa  86.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  32.52 
 
 
310 aa  85.9  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  35.37 
 
 
280 aa  85.5  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.54 
 
 
310 aa  85.5  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  30.95 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  30.54 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.24 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  26.91 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  34.38 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  33.33 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  31.61 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  34.81 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  27.83 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  26.82 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  31.71 
 
 
311 aa  79  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
296 aa  79  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  33.75 
 
 
311 aa  79  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  27.43 
 
 
829 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  31.25 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  29.78 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  28.48 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  32.07 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  29.75 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  28.35 
 
 
832 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.96 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  32.48 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.05 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  40 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  31.85 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  29.85 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  30 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  33.61 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  34.75 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.29 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  31.15 
 
 
357 aa  68.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  31.06 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  27.85 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  28.03 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 
572 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  28.49 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  30 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  29.41 
 
 
559 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  28.3 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
228 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
200 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
200 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.82 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>