More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1988 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  100 
 
 		 204 aa  426  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  82.84 
 
 		 204 aa  362  3e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  84.58 
 
 		 204 aa  358  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  82.84 
 
 		 204 aa  357  6e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  77.11 
 
 		 204 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  77.61 
 
 		 204 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  77.11 
 
 		 204 aa  338  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  76.62 
 
 		 204 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  77.11 
 
 		 205 aa  330  8e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  48.53 
 
 		 202 aa  201  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  40.11 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.8 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  38.5 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  37.97 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  32.05 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  33.87 
 
 		 347 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  29.49 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  31.47 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  29.88 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 250 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  45.78 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  42.45 
 
 		 331 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 332 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  39.62 
 
 		 327 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.58 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32.73 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 634 aa  65.1  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.98 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  30.3 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  33.64 
 
 		 270 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  31.68 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  26.92 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  37.6 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  27.53 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  34.31 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  29.47 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  27.34 
 
 		 829 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  33.64 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  29.28 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.29 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.08 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  33.64 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 231 aa  62  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.14 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.73 
 
 		 266 aa  62  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  29.03 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>