More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3903 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  100 
 
 
198 aa  400  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  100 
 
 
198 aa  400  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  46.99 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  43.63 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  38.31 
 
 
202 aa  127  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  40.8 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  40 
 
 
207 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  38.5 
 
 
202 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  40 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  37.36 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  36.81 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  35.03 
 
 
205 aa  111  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
204 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  33.84 
 
 
204 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  33.84 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  33.84 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  34.07 
 
 
204 aa  101  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  34.59 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  38.18 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  31.51 
 
 
270 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  42.48 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  27.46 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  34.68 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  28.48 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  27.97 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 
1106 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  38.4 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  37.93 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  27.4 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 
258 aa  65.1  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 
268 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  36.72 
 
 
260 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  39.37 
 
 
248 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  29.71 
 
 
241 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  36.31 
 
 
264 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.21 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
269 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  34.78 
 
 
658 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
255 aa  62.4  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  33.51 
 
 
261 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  30.08 
 
 
246 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
241 aa  62  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
295 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0767  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
194 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.763548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.66 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.2 
 
 
234 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
252 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  33.67 
 
 
262 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  30.69 
 
 
429 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 
331 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 
244 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
266 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  33.95 
 
 
274 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  34.1 
 
 
259 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  34.1 
 
 
259 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  33.14 
 
 
246 aa  59.3  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000587821  hitchhiker  0.0091617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
267 aa  58.9  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
236 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
295 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  38.1 
 
 
331 aa  58.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  35.9 
 
 
243 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  35 
 
 
238 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 
310 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2782  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
234 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320592  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  36.75 
 
 
246 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.83 
 
 
234 aa  58.2  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.83 
 
 
243 aa  58.2  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  36.75 
 
 
246 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  30 
 
 
324 aa  58.2  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.99 
 
 
254 aa  57.8  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 
237 aa  58.2  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.04 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
328 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  33.64 
 
 
274 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.19 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  28.57 
 
 
283 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  33.93 
 
 
265 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  37.19 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  35 
 
 
291 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.73 
 
 
258 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.71 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.57 
 
 
282 aa  56.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.52 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
334 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
248 aa  56.2  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  35.9 
 
 
246 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>