More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3246 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  100 
 
 
255 aa  508  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  61.66 
 
 
258 aa  294  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  45.54 
 
 
270 aa  181  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  49.73 
 
 
347 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  34.26 
 
 
832 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  32.48 
 
 
829 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  48.76 
 
 
319 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  36.88 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0241  hypothetical protein  32.09 
 
 
324 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  43.81 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  43.81 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  43.81 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  43.81 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.81 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  43.81 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  43.81 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0242  hypothetical protein  30.6 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  40 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.06 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  43.4 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.2 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  44 
 
 
634 aa  72  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  37.84 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  43.16 
 
 
1106 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  37.86 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  34.71 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.38 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.41 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.52 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  35.04 
 
 
202 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.52 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  38.71 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  37.23 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  37.59 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  36.52 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.52 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  36.52 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.94 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  42.99 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  41.75 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  37 
 
 
392 aa  65.5  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  39.62 
 
 
250 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
285 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
205 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.78 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.78 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.75 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  32.33 
 
 
387 aa  63.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  39.25 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  44 
 
 
1032 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  36.36 
 
 
306 aa  63.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.56 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.65 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  33.93 
 
 
198 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  38.02 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  37.68 
 
 
382 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  40.59 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  33.93 
 
 
198 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.81 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
199 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.56 
 
 
236 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
215 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
204 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
204 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  42.16 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
204 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
236 aa  63.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
293 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  42.16 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  29 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
286 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0228  Methyltransferase type 11  38.13 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  45.28 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  41.05 
 
 
236 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  34.59 
 
 
204 aa  62.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
204 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
250 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  33.94 
 
 
226 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 
226 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  40 
 
 
284 aa  62.4  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  40.78 
 
 
250 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  33.66 
 
 
262 aa  62  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  37.4 
 
 
279 aa  62  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  33.66 
 
 
262 aa  62  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  36.13 
 
 
300 aa  62  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>