More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0242 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0242  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  750    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0241  hypothetical protein  96.6 
 
 
324 aa  652    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
319 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  36.28 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  36.11 
 
 
347 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  27.19 
 
 
832 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  32 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  36 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  33.33 
 
 
829 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  36 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  30.1 
 
 
202 aa  62.8  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 
200 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 
200 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32.08 
 
 
202 aa  60.1  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 
210 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
280 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
196 aa  59.7  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
270 aa  59.3  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
204 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  27.13 
 
 
204 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  29.46 
 
 
196 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
209 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.17 
 
 
261 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
204 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  25.58 
 
 
204 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  25.58 
 
 
204 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
271 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
201 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.16 
 
 
258 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  28.21 
 
 
196 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  24.81 
 
 
204 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.43 
 
 
282 aa  56.2  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
271 aa  56.2  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  25 
 
 
208 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  28.46 
 
 
206 aa  56.2  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
240 aa  56.2  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
199 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3751  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
243 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.21 
 
 
223 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.72 
 
 
200 aa  55.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  30.61 
 
 
278 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  28.21 
 
 
208 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
283 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 
221 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.75 
 
 
205 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
366 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  28.17 
 
 
261 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
236 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
295 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  24.03 
 
 
204 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
293 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
314 aa  54.3  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  28.17 
 
 
261 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.17 
 
 
261 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  28.04 
 
 
204 aa  53.5  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.17 
 
 
258 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.17 
 
 
258 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  28.73 
 
 
309 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  31.78 
 
 
306 aa  53.1  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  32.29 
 
 
225 aa  53.1  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  29.37 
 
 
261 aa  53.1  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
283 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  31.47 
 
 
318 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  27.35 
 
 
196 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
313 aa  53.1  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  23.93 
 
 
211 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  28.04 
 
 
205 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  26.04 
 
 
207 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.43 
 
 
386 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
282 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
253 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.46 
 
 
261 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  25.71 
 
 
291 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  27.78 
 
 
201 aa  52.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  28.73 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
295 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  31.73 
 
 
392 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  25.88 
 
 
264 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  27.27 
 
 
400 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.64 
 
 
258 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
225 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  28.35 
 
 
305 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  31.73 
 
 
658 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.96 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.26 
 
 
244 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
244 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
296 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  30 
 
 
251 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 
214 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.73 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
207 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  22.08 
 
 
333 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  25.49 
 
 
244 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 
634 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  25.74 
 
 
239 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
296 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  24.35 
 
 
291 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  30 
 
 
271 aa  50.4  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>