More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1804 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  100 
 
 		 832 aa  1648    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  42.55 
 
 		 829 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.19 
 
 		 1337 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.25 
 
 		 261 aa  153  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  37.67 
 
 		 271 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  36.5 
 
 		 278 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  32.52 
 
 		 252 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.39 
 
 		 291 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.62 
 
 		 251 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.62 
 
 		 251 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.86 
 
 		 281 aa  132  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  32.44 
 
 		 258 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.33 
 
 		 250 aa  128  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  33.33 
 
 		 257 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  31.43 
 
 		 249 aa  126  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  34.6 
 
 		 248 aa  127  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.83 
 
 		 278 aa  125  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.08 
 
 		 274 aa  124  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.02 
 
 		 256 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  37.55 
 
 		 239 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  40.34 
 
 		 258 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  31.33 
 
 		 235 aa  122  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  31.43 
 
 		 249 aa  122  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  30.87 
 
 		 258 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  35.29 
 
 		 239 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.59 
 
 		 256 aa  119  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54910  putative thioesterase  32.1 
 
 		 271 aa  119  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  34.51 
 
 		 252 aa  118  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  32.1 
 
 		 248 aa  118  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  35.62 
 
 		 245 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  33.2 
 
 		 260 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  30.49 
 
 		 248 aa  117  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.05 
 
 		 242 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2122  linear gramicidin dehydrogenase LgrE  31.74 
 
 		 255 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.96 
 
 		 250 aa  115  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  35.56 
 
 		 239 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.86 
 
 		 281 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.78 
 
 		 253 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.74 
 
 		 246 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  34.67 
 
 		 248 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  35.11 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1333  Thioesterase  31.33 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  33.33 
 
 		 264 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  31.3 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  33.73 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2428  thioesterase  38.79 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79067  hitchhiker  0.00311284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  25.9 
 
 		 1354 aa  110  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  33.33 
 
 		 260 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  34.4 
 
 		 257 aa  110  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  33.33 
 
 		 265 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  33.33 
 
 		 265 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5286  thioesterase  33.94 
 
 		 257 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0605968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 255 aa  109  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  26.45 
 
 		 278 aa  110  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  34.78 
 
 		 245 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2147  pyochelin biosynthetic protein  30.93 
 
 		 257 aa  109  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00348724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  32.81 
 
 		 250 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0783  pyochelin biosynthetic protein PchC  30.93 
 
 		 257 aa  109  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0873  pyochelin biosynthetic protein PchC  30.93 
 
 		 257 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  31.75 
 
 		 251 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1758  Thioesterase  33.74 
 
 		 261 aa  108  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  hitchhiker  0.00873666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  34.11 
 
 		 347 aa  108  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.24 
 
 		 255 aa  107  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0161  thioesterase  32.82 
 
 		 436 aa  107  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  31.35 
 
 		 251 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7295  thioesterase  33.8 
 
 		 264 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0578517  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  34.22 
 
 		 284 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  32.47 
 
 		 270 aa  107  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1831  pyochelin biosynthetic protein  32.41 
 
 		 257 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  32 
 
 		 267 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33270  PvdG  34.07 
 
 		 254 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275002  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3366  thioesterase  33.63 
 
 		 257 aa  105  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5001  thioesterase  33.63 
 
 		 257 aa  105  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0435421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  34.38 
 
 		 254 aa  104  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  33.78 
 
 		 236 aa  104  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  34.38 
 
 		 254 aa  104  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.27 
 
 		 267 aa  103  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3421  Thioesterase  32.73 
 
 		 228 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00113491  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3475  Thioesterase  32.2 
 
 		 269 aa  102  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3969  Thioesterase  29.13 
 
 		 246 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  30.43 
 
 		 259 aa  102  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  32.92 
 
 		 259 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2828  thioesterase  34.65 
 
 		 254 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  35.71 
 
 		 251 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  26.96 
 
 		 240 aa  100  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  34.09 
 
 		 251 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  28.84 
 
 		 250 aa  99.8  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  30.89 
 
 		 280 aa  98.6  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32 
 
 		 291 aa  98.2  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4759  thioesterase  32.44 
 
 		 247 aa  98.2  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2598  yersiniabactin synthetase, thioesterase component  29.15 
 
 		 271 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.494372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  27.8 
 
 		 240 aa  97.8  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.51 
 
 		 240 aa  97.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3130  thioesterase  31.11 
 
 		 247 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.940368  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  32.76 
 
 		 2125 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1932b  thioesterase  25.1 
 
 		 481 aa  95.1  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5926  thioesterase  32.91 
 
 		 266 aa  95.5  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.023654  normal  0.0208655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2451  thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis-like  31.28 
 
 		 261 aa  95.1  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904446  normal  0.835593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  27.78 
 
 		 253 aa  94.7  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  27.07 
 
 		 240 aa  94.4  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>