185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2134 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  100 
 
 		 248 aa  507  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  92.74 
 
 		 252 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  58.55 
 
 		 248 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2828  thioesterase  52.02 
 
 		 254 aa  261  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33270  PvdG  51 
 
 		 254 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275002  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  55.6 
 
 		 245 aa  254  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  56.03 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  56.58 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  56 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  55.56 
 
 		 239 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  55.31 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  53.65 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1834  thioesterase  49.32 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.80691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4759  thioesterase  42.47 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3749  Thioesterase  40.34 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.501691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  43.17 
 
 		 278 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.17 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  41.33 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  35.86 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.64 
 
 		 1337 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  39.39 
 
 		 280 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  39.39 
 
 		 280 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  39.39 
 
 		 280 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  38.53 
 
 		 280 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  35.75 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.5 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.5 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  38.14 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.82 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3735  thioesterase  42.61 
 
 		 258 aa  144  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366799  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  34.76 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.91 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.6 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.62 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  34.33 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  34.33 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  34.33 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  32.27 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  35.11 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  31.14 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.19 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  29.11 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  36.56 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1085  hypothetical protein  43.79 
 
 		 172 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.742128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1970  putative thiesterase family protein  38.6 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  33.33 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  35.24 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2428  thioesterase  39.63 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79067  hitchhiker  0.00311284 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  31.06 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  33.77 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  34.4 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  35.27 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  30.04 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3421  Thioesterase  30.53 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00113491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  35.27 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.35 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54910  putative thioesterase  37.13 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  33.94 
 
 		 1354 aa  128  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.37 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.23 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0025  type II thioesterase, CesT  32.56 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.41 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.14 
 
 		 240 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  34.38 
 
 		 260 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4057  Thioesterase  35.75 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.04 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  32.49 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1779  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.32 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140397  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  35.24 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4690  CFA synthetase, thioesterase component  32.03 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  28.7 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  33.92 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  32.75 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.14 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  33.76 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0161  thioesterase  36.11 
 
 		 436 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  32.61 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  34.67 
 
 		 832 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.8 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  33.04 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  31.96 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.64 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  29.73 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.37 
 
 		 2839 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.37 
 
 		 2832 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3130  thioesterase  31.58 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.940368  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  32.27 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.37 
 
 		 2839 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  32.37 
 
 		 2832 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2512  Thioesterase  28.44 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3448  Thioesterase  35.41 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0133  putative thioesterase  32.74 
 
 		 291 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  31.95 
 
 		 2835 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1642  thioesterase domain-containing protein  32.74 
 
 		 303 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1561  thioesterase domain-containing protein  32.74 
 
 		 291 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2122  linear gramicidin dehydrogenase LgrE  30.88 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  34.56 
 
 		 829 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1831  pyochelin biosynthetic protein  33.48 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.49 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  32.29 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>