161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1085 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1085  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  344  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.742128  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  48.75 
 
 
239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  47.5 
 
 
239 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  47.5 
 
 
239 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  47.5 
 
 
239 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  46.99 
 
 
245 aa  141  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  45.14 
 
 
248 aa  140  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  43.79 
 
 
248 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  44.67 
 
 
252 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  44.52 
 
 
254 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  43.87 
 
 
254 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.49 
 
 
251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.49 
 
 
251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2828  thioesterase  41.83 
 
 
254 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1834  thioesterase  41.14 
 
 
253 aa  117  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.80691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33270  PvdG  41.33 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275002  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  40.76 
 
 
252 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.25 
 
 
1337 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  41.06 
 
 
278 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.04 
 
 
261 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4759  thioesterase  37.97 
 
 
247 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.28 
 
 
256 aa  108  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.42 
 
 
250 aa  107  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3749  Thioesterase  39.38 
 
 
246 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.501691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.14 
 
 
256 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  35.26 
 
 
240 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  38.61 
 
 
247 aa  97.1  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.12 
 
 
281 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  33.74 
 
 
240 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  32.69 
 
 
258 aa  94.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  35.23 
 
 
829 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  32.52 
 
 
242 aa  93.6  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  32.3 
 
 
235 aa  92.8  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.9 
 
 
278 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.97 
 
 
240 aa  91.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3735  thioesterase  35.85 
 
 
258 aa  91.7  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366799  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1970  putative thiesterase family protein  40.79 
 
 
254 aa  91.3  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  37.5 
 
 
259 aa  90.5  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.06 
 
 
291 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.9 
 
 
281 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  38.31 
 
 
260 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.48 
 
 
242 aa  89  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  35.06 
 
 
280 aa  89  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  38.31 
 
 
265 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  38.31 
 
 
265 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  37.82 
 
 
250 aa  88.6  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  38.31 
 
 
260 aa  88.2  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.18 
 
 
253 aa  88.2  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  34.18 
 
 
236 aa  88.2  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  30.67 
 
 
250 aa  87.8  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  33.53 
 
 
280 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7295  thioesterase  36.02 
 
 
264 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0578517  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  33.53 
 
 
280 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  33.53 
 
 
280 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4057  Thioesterase  34.08 
 
 
259 aa  85.9  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  32.93 
 
 
257 aa  85.5  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  40 
 
 
266 aa  85.1  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  28.75 
 
 
253 aa  84.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  28.4 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  39.49 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  33.33 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  36.54 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0025  type II thioesterase, CesT  30.57 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12943  thioesterase tesA  35.4 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  37.97 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  33.33 
 
 
248 aa  82  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.71 
 
 
291 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.06 
 
 
267 aa  81.6  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1779  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.93 
 
 
239 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3421  Thioesterase  32.48 
 
 
228 aa  81.3  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00113491  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.71 
 
 
250 aa  81.3  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.33 
 
 
255 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0133  putative thioesterase  35.9 
 
 
291 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1642  thioesterase domain-containing protein  35.9 
 
 
303 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1561  thioesterase domain-containing protein  35.9 
 
 
291 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4690  CFA synthetase, thioesterase component  30.3 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1333  Thioesterase  33.97 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  33.95 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  35.76 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.99 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5687  thioesterase  35.37 
 
 
256 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0638728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3969  Thioesterase  30.72 
 
 
246 aa  79  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0630  Thioesterase  35.58 
 
 
251 aa  78.2  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.18 
 
 
246 aa  77.8  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  31.52 
 
 
271 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0161  thioesterase  38.46 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4555  thioesterase  34.36 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.308008  normal  0.0177452 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  34.59 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3130  thioesterase  36.42 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.940368  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.96 
 
 
2792 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  34.34 
 
 
832 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2099  thioesterase  33.55 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  30.82 
 
 
251 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  34.59 
 
 
267 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3448  Thioesterase  33.54 
 
 
264 aa  74.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2512  Thioesterase  28.12 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5926  thioesterase  35.26 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.023654  normal  0.0208655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  30.82 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  36.08 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0343  thioesterase  29.94 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>