171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7295 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7295  thioesterase  100 
 
 
264 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0578517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.23 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.95 
 
 
1337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.85 
 
 
291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  38.71 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  37.93 
 
 
239 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  38.57 
 
 
248 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  35.05 
 
 
249 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  37.12 
 
 
239 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  35.19 
 
 
251 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  37.5 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  35.84 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  37.5 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  39.46 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1333  Thioesterase  33.33 
 
 
247 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.18 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.58 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.12 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  33.18 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  34.76 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.12 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.31 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  38.03 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  37.84 
 
 
254 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0133  putative thioesterase  35.29 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  35.29 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.7 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1642  thioesterase domain-containing protein  35.29 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1561  thioesterase domain-containing protein  35.29 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.9 
 
 
256 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  28.84 
 
 
240 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  33.33 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  33.33 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  33.33 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  32.48 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  28.24 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  32.87 
 
 
248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  32.6 
 
 
249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  33.8 
 
 
258 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  32.87 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3749  Thioesterase  34.27 
 
 
246 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.501691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4759  thioesterase  33.76 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  34.98 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  32.08 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2147  pyochelin biosynthetic protein  32.16 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00348724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  32.56 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0873  pyochelin biosynthetic protein PchC  32.16 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0783  pyochelin biosynthetic protein PchC  32.16 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  30.64 
 
 
253 aa  109  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  30.33 
 
 
278 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.23 
 
 
291 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  32.56 
 
 
280 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  32.41 
 
 
257 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1834  thioesterase  35.35 
 
 
253 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.80691  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  32.56 
 
 
280 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  32.56 
 
 
280 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.19 
 
 
246 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  35.55 
 
 
259 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  33.8 
 
 
832 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0161  thioesterase  37.29 
 
 
436 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5286  thioesterase  32.41 
 
 
257 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0605968  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  33.81 
 
 
248 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  35.37 
 
 
242 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1831  pyochelin biosynthetic protein  31.94 
 
 
257 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.81 
 
 
274 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  34.27 
 
 
266 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  30.99 
 
 
250 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  33.49 
 
 
248 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  35.75 
 
 
271 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3366  thioesterase  31.94 
 
 
257 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5001  thioesterase  31.94 
 
 
257 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0435421  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2122  linear gramicidin dehydrogenase LgrE  30.4 
 
 
255 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1970  putative thiesterase family protein  35.55 
 
 
254 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.54 
 
 
278 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  36.44 
 
 
245 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  30.97 
 
 
247 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33270  PvdG  33.33 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275002  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1779  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  24.14 
 
 
239 aa  99.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140397  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  30.73 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  24.56 
 
 
235 aa  99  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  31.65 
 
 
284 aa  98.6  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.03 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  31.1 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  32.57 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.7 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  33.8 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  27.69 
 
 
829 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3969  Thioesterase  31.78 
 
 
246 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0025  type II thioesterase, CesT  27.56 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  26.54 
 
 
259 aa  96.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2598  yersiniabactin synthetase, thioesterase component  31.53 
 
 
271 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.494372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  33.18 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3421  Thioesterase  36.97 
 
 
228 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00113491  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.19 
 
 
253 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5926  thioesterase  33.33 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.023654  normal  0.0208655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2296  Thioesterase  29.05 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.81 
 
 
281 aa  92  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3863  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.51 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181058  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2451  thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis-like  26.17 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904446  normal  0.835593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2828  thioesterase  29.92 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>