171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2296 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2296  Thioesterase  100 
 
 
252 aa  494  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0527  Thioesterase  43.44 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224136  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  33.33 
 
 
252 aa  148  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.64 
 
 
281 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  34.68 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.09 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.39 
 
 
256 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.18 
 
 
1337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.2 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.2 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  36.4 
 
 
264 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  29.2 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  26.96 
 
 
240 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.15 
 
 
242 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  35.59 
 
 
250 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.57 
 
 
291 aa  121  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  27.11 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.2 
 
 
256 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1333  Thioesterase  35.53 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.44 
 
 
253 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.02 
 
 
246 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0404  thioesterase domain-containing protein  35.74 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4057  Thioesterase  38.7 
 
 
259 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  36.36 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  35.12 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  36.36 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  34.32 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.93 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  28.81 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3448  Thioesterase  38.21 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  34.33 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  31.6 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  34.33 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  34.33 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.09 
 
 
261 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  33.88 
 
 
257 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1758  Thioesterase  34.96 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  hitchhiker  0.00873666 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0645  thioesterase domain-containing protein  35.78 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0198  thioesterase domain-containing protein  35.78 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1395  thioesterase domain-containing protein  35.78 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.397632  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3223  thioesterase domain-containing protein  35.81 
 
 
259 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.61 
 
 
250 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0462  thioesterase domain-containing protein  35.81 
 
 
259 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0481  thioesterase domain-containing protein  35.81 
 
 
259 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2821  thioesterase domain-containing protein  35.81 
 
 
259 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  31.15 
 
 
258 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  34.16 
 
 
257 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  28.63 
 
 
259 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  33.47 
 
 
239 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  25.78 
 
 
235 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3366  thioesterase  32.23 
 
 
257 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5001  thioesterase  32.23 
 
 
257 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0435421  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0161  thioesterase  37.72 
 
 
436 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  30.53 
 
 
252 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  28.95 
 
 
271 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.21 
 
 
278 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  32.43 
 
 
248 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1831  pyochelin biosynthetic protein  31.82 
 
 
257 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  27.73 
 
 
242 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5286  thioesterase  32.23 
 
 
257 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0605968  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.75 
 
 
267 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  32.9 
 
 
236 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  28.1 
 
 
1354 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  32.77 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  32.63 
 
 
280 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  32.63 
 
 
280 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  32.63 
 
 
280 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  31.93 
 
 
280 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  33.63 
 
 
248 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3863  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.16 
 
 
260 aa  99  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181058  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  35.2 
 
 
829 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  26.79 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  27.97 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2512  Thioesterase  25.64 
 
 
236 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  31.62 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2147  pyochelin biosynthetic protein  30.99 
 
 
257 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00348724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54910  putative thioesterase  32.89 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0783  pyochelin biosynthetic protein PchC  30.99 
 
 
257 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0873  pyochelin biosynthetic protein PchC  30.99 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  25.32 
 
 
278 aa  96.3  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  32.62 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.9 
 
 
281 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3969  Thioesterase  28.95 
 
 
246 aa  95.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  31.91 
 
 
254 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2122  linear gramicidin dehydrogenase LgrE  31.07 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3421  Thioesterase  31.44 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00113491  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  31.9 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5687  thioesterase  31.63 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0638728 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  31.9 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  31.08 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  31.3 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.98 
 
 
2792 aa  92.8  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  28.87 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7295  thioesterase  29.05 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0578517  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33270  PvdG  29.96 
 
 
254 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275002  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  34.98 
 
 
2835 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.13 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  30.13 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  34.52 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  34.87 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>