188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1962 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  100 
 
 		 239 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  99.16 
 
 		 239 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  92.89 
 
 		 239 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  83.26 
 
 		 239 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  67.81 
 
 		 245 aa  315  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  68.1 
 
 		 248 aa  311  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  64.83 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  64.96 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  56.89 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  55.56 
 
 		 248 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2828  thioesterase  50 
 
 		 254 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33270  PvdG  48.21 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275002  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3749  Thioesterase  45.22 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.501691  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1834  thioesterase  45.22 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.80691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4759  thioesterase  45.85 
 
 		 247 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  40.17 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3735  thioesterase  45.42 
 
 		 258 aa  165  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366799  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.36 
 
 		 1337 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  42.79 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  38.79 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.26 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  36.07 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.09 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.09 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  33.62 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  39.57 
 
 		 280 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  39.57 
 
 		 280 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  39.57 
 
 		 280 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  39.15 
 
 		 280 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  38.05 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  35.9 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1085  hypothetical protein  47.5 
 
 		 172 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.742128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  36.29 
 
 		 247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  35.62 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.93 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  35.62 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1970  putative thiesterase family protein  38.91 
 
 		 254 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  30.83 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.71 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  37 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4057  Thioesterase  37.07 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  35.62 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  35.62 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  35.62 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  37.99 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1779  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.04 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140397  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  31.15 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.62 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  33.19 
 
 		 249 aa  134  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.24 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.11 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.99 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  38.59 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  29.75 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.5 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0025  type II thioesterase, CesT  31.8 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  33.05 
 
 		 249 aa  131  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  33.33 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  35.17 
 
 		 271 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  29.96 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.36 
 
 		 291 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  36.32 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  37.07 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.8 
 
 		 291 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2428  thioesterase  41.36 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79067  hitchhiker  0.00311284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  37.18 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4690  CFA synthetase, thioesterase component  36.09 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3421  Thioesterase  31.8 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00113491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  37.45 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.5 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.05 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.93 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7295  thioesterase  37.5 
 
 		 264 aa  121  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0578517  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2512  Thioesterase  28.51 
 
 		 236 aa  121  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  36.29 
 
 		 829 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.17 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  36.16 
 
 		 280 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  35.47 
 
 		 2792 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  37.12 
 
 		 266 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  37.99 
 
 		 251 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0133  putative thioesterase  34.98 
 
 		 291 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3863  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.96 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.9 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1642  thioesterase domain-containing protein  34.98 
 
 		 303 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1561  thioesterase domain-containing protein  34.98 
 
 		 291 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  26.36 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1333  Thioesterase  32.07 
 
 		 247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0687  putative thioesterase  32.46 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  35.47 
 
 		 2835 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0755  thioesterase  32.46 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  35.47 
 
 		 2839 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  35.47 
 
 		 2832 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  35.47 
 
 		 2839 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  35.47 
 
 		 2832 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3969  Thioesterase  32.91 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  35.11 
 
 		 832 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  36.71 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  36.68 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  30.64 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>