More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3033 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  100 
 
 		 829 aa  1664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  42.83 
 
 		 832 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0161  thioesterase  50 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  37.7 
 
 		 252 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.55 
 
 		 256 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.66 
 
 		 1337 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.07 
 
 		 281 aa  152  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.26 
 
 		 291 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  36.44 
 
 		 247 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.12 
 
 		 261 aa  148  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.55 
 
 		 242 aa  144  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  38.18 
 
 		 236 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  39.19 
 
 		 264 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.04 
 
 		 251 aa  141  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.04 
 
 		 251 aa  141  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.21 
 
 		 256 aa  140  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.45 
 
 		 250 aa  140  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  42.79 
 
 		 278 aa  139  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  38.71 
 
 		 265 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  38.71 
 
 		 265 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  38.71 
 
 		 260 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  38.4 
 
 		 260 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1758  Thioesterase  39.11 
 
 		 261 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  hitchhiker  0.00873666 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  32.87 
 
 		 250 aa  135  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  34.96 
 
 		 248 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  38.59 
 
 		 259 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.44 
 
 		 281 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.5 
 
 		 255 aa  134  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  33.48 
 
 		 240 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.49 
 
 		 240 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.27 
 
 		 267 aa  130  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  37.45 
 
 		 239 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  37.13 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54910  putative thioesterase  37.87 
 
 		 271 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  38.29 
 
 		 266 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  33.61 
 
 		 258 aa  127  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  32.58 
 
 		 240 aa  126  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.17 
 
 		 253 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  36.57 
 
 		 278 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  31.62 
 
 		 258 aa  125  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  34.87 
 
 		 257 aa  124  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0687  putative thioesterase  34.03 
 
 		 254 aa  124  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  37.24 
 
 		 250 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3969  Thioesterase  33.33 
 
 		 246 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0755  thioesterase  33.61 
 
 		 254 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1333  Thioesterase  33.19 
 
 		 247 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  36.29 
 
 		 239 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.93 
 
 		 250 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  33.6 
 
 		 248 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  29.55 
 
 		 240 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.04 
 
 		 274 aa  121  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  36.29 
 
 		 239 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.1 
 
 		 246 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  36.4 
 
 		 251 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  31.97 
 
 		 260 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  36.68 
 
 		 267 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  35.19 
 
 		 252 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  35.6 
 
 		 251 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  36.36 
 
 		 254 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  36.28 
 
 		 249 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  29.73 
 
 		 235 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  33.33 
 
 		 251 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  32.87 
 
 		 253 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  35.83 
 
 		 284 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2147  pyochelin biosynthetic protein  35.47 
 
 		 257 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00348724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  30.08 
 
 		 278 aa  115  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0783  pyochelin biosynthetic protein PchC  35.47 
 
 		 257 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3099  Thioesterase  33.19 
 
 		 260 aa  115  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0873  pyochelin biosynthetic protein PchC  35.53 
 
 		 257 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  32.91 
 
 		 251 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  30.14 
 
 		 242 aa  114  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5286  thioesterase  35.11 
 
 		 257 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0605968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  33.04 
 
 		 280 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.45 
 
 		 291 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1642  thioesterase domain-containing protein  32.61 
 
 		 303 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1561  thioesterase domain-containing protein  32.61 
 
 		 291 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0133  putative thioesterase  32.61 
 
 		 291 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  34.89 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  33.2 
 
 		 271 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  34.22 
 
 		 249 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5687  thioesterase  34.75 
 
 		 256 aa  112  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0638728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  36.21 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  34.56 
 
 		 248 aa  111  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1831  pyochelin biosynthetic protein  34.91 
 
 		 257 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3366  thioesterase  34.32 
 
 		 257 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5001  thioesterase  34.32 
 
 		 257 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0435421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  34.74 
 
 		 2835 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  35.4 
 
 		 248 aa  110  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12943  thioesterase tesA  32.26 
 
 		 261 aa  108  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0025  type II thioesterase, CesT  33.04 
 
 		 237 aa  108  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  28.95 
 
 		 259 aa  108  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0630  Thioesterase  33.76 
 
 		 251 aa  108  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3130  thioesterase  35.62 
 
 		 247 aa  108  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.940368  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4759  thioesterase  33.33 
 
 		 247 aa  107  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.04 
 
 		 2839 aa  107  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.04 
 
 		 2832 aa  107  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.04 
 
 		 2839 aa  107  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0645  thioesterase domain-containing protein  37.27 
 
 		 257 aa  107  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0481  thioesterase domain-containing protein  37.5 
 
 		 259 aa  107  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2821  thioesterase domain-containing protein  37.5 
 
 		 259 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>