184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3728 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  100 
 
 		 253 aa  526  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  36.36 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.5 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  38.3 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1779  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.44 
 
 		 239 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140397  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  35.8 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  37.72 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.53 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.08 
 
 		 278 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  33.61 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  38.01 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  34.71 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.42 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  34.71 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  34.71 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  34.71 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  36.89 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.84 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.48 
 
 		 1337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  34.17 
 
 		 271 aa  151  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.06 
 
 		 250 aa  151  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  37.3 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.75 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.75 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.57 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.63 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.82 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  32.78 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  34.55 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  31.9 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0025  type II thioesterase, CesT  32.77 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  32.78 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  36.94 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2122  linear gramicidin dehydrogenase LgrE  31.33 
 
 		 255 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  33.04 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  36.04 
 
 		 251 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.04 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  32.61 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4690  CFA synthetase, thioesterase component  34.05 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.22 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  32.02 
 
 		 254 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.78 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  30.43 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  35.04 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  33.47 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.19 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2512  Thioesterase  29.39 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  29.96 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54910  putative thioesterase  33.33 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  31.58 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  32.74 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  28.98 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  29.96 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.95 
 
 		 291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  32.89 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  34.73 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  34.73 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  34.73 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1333  Thioesterase  31.19 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3969  Thioesterase  32.47 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  34.23 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  33.89 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.52 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  30.4 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  30.43 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  30.87 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  29.63 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2147  pyochelin biosynthetic protein  32.37 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00348724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0873  pyochelin biosynthetic protein PchC  32.37 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0783  pyochelin biosynthetic protein PchC  32.37 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2828  thioesterase  29.54 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1831  pyochelin biosynthetic protein  32.08 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  30.77 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  30.84 
 
 		 1354 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  30.34 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  32.31 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  30 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5286  thioesterase  31.74 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0605968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  31.47 
 
 		 249 aa  118  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4057  Thioesterase  30.87 
 
 		 259 aa  118  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.33 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.39 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  28.7 
 
 		 248 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  32.87 
 
 		 829 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0687  putative thioesterase  29.88 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0755  thioesterase  29.88 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1834  thioesterase  28.97 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.80691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33270  PvdG  27.54 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275002  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  29.09 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3366  thioesterase  31.74 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5001  thioesterase  31.74 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0435421  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2598  yersiniabactin synthetase, thioesterase component  29.54 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.494372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  28.7 
 
 		 242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0133  putative thioesterase  31.22 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1642  thioesterase domain-containing protein  31.22 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1561  thioesterase domain-containing protein  31.22 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3448  Thioesterase  31.63 
 
 		 264 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1970  putative thiesterase family protein  32.26 
 
 		 254 aa  111  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  27.5 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0161  thioesterase  30.87 
 
 		 436 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>