175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2598 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2598  yersiniabactin synthetase, thioesterase component  100 
 
 
271 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.494372  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2433  thioesterase  56.45 
 
 
257 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.823323  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2095  yersiniabactin biosynthesis thioesterase YbtT  50.21 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02103  hypothetical protein  44.44 
 
 
208 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  34.52 
 
 
247 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  29.39 
 
 
250 aa  136  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.47 
 
 
256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1831  pyochelin biosynthetic protein  34.51 
 
 
257 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3475  Thioesterase  30.08 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449577  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  35.04 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3969  Thioesterase  31.95 
 
 
246 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  35.22 
 
 
257 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2147  pyochelin biosynthetic protein  33.99 
 
 
257 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00348724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0873  pyochelin biosynthetic protein PchC  33.99 
 
 
257 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0783  pyochelin biosynthetic protein PchC  33.99 
 
 
257 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  37.61 
 
 
251 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.36 
 
 
250 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0133  putative thioesterase  34.62 
 
 
291 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1642  thioesterase domain-containing protein  34.62 
 
 
303 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1561  thioesterase domain-containing protein  34.62 
 
 
291 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  38.39 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  36.84 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3366  thioesterase  34.29 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5001  thioesterase  34.29 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0435421  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5286  thioesterase  33.2 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0605968  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  35.74 
 
 
251 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  32.82 
 
 
257 aa  118  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.43 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  33.19 
 
 
258 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.79 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54910  putative thioesterase  32.3 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  28.74 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  35.71 
 
 
259 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  29.54 
 
 
253 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  30.4 
 
 
259 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  33.33 
 
 
278 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  25.54 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0161  thioesterase  36 
 
 
436 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  26.41 
 
 
240 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  25.65 
 
 
240 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.47 
 
 
246 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  28.82 
 
 
267 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.32 
 
 
278 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.3 
 
 
291 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.65 
 
 
242 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  31.02 
 
 
252 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  30.45 
 
 
249 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  28.82 
 
 
284 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.33 
 
 
274 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  31.66 
 
 
260 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  29.54 
 
 
242 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  32.32 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  32.2 
 
 
265 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.71 
 
 
251 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  32.2 
 
 
265 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1970  putative thiesterase family protein  31.91 
 
 
254 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.71 
 
 
251 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  26.16 
 
 
240 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.78 
 
 
281 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  34.74 
 
 
245 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.17 
 
 
250 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1758  Thioesterase  34.98 
 
 
261 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  hitchhiker  0.00873666 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1779  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  24.68 
 
 
239 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140397  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  28.09 
 
 
248 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5926  thioesterase  33.61 
 
 
266 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.023654  normal  0.0208655 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  28.39 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2099  thioesterase  28.18 
 
 
239 aa  99.8  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.36 
 
 
281 aa  99  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.2 
 
 
255 aa  99  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  29.15 
 
 
832 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  32.08 
 
 
248 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.41 
 
 
267 aa  96.3  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0755  thioesterase  31.14 
 
 
254 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  30.83 
 
 
252 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  38.16 
 
 
250 aa  95.9  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0687  putative thioesterase  31.14 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  33.06 
 
 
245 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7295  thioesterase  31.53 
 
 
264 aa  95.5  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0578517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0630  Thioesterase  28.15 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.65 
 
 
2839 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  28.51 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.65 
 
 
2832 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.65 
 
 
2839 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  34.38 
 
 
239 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  32.65 
 
 
2832 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  29.87 
 
 
280 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  33.02 
 
 
266 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  33.61 
 
 
239 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2512  Thioesterase  25.22 
 
 
236 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2428  thioesterase  34.32 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79067  hitchhiker  0.00311284 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  31.84 
 
 
2835 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  35.5 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1932b  thioesterase  27.17 
 
 
481 aa  92.8  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0025  type II thioesterase, CesT  26.61 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  35.06 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  30.47 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.46 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  30.47 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  30.47 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.45 
 
 
1337 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>