179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1603 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  100 
 
 
266 aa  525  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  37.99 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.4 
 
 
281 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.81 
 
 
242 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.87 
 
 
274 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.17 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.98 
 
 
291 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.37 
 
 
251 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.37 
 
 
251 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.55 
 
 
1337 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  41.28 
 
 
245 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  35.35 
 
 
258 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  34.98 
 
 
248 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.29 
 
 
256 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.34 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  37.77 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.76 
 
 
246 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  40.55 
 
 
250 aa  138  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  40 
 
 
280 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  40.43 
 
 
280 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  40 
 
 
280 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  40 
 
 
280 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5687  thioesterase  40.91 
 
 
256 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0638728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.39 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  41.41 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.44 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  35.15 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.55 
 
 
255 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  36.21 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  35.78 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  36.21 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  36.21 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  39.37 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  36.11 
 
 
829 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  37.39 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  37.72 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  39.83 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  36.33 
 
 
258 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3863  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.13 
 
 
260 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181058  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.68 
 
 
256 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  29.13 
 
 
235 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0133  putative thioesterase  37.99 
 
 
291 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  35.71 
 
 
239 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1642  thioesterase domain-containing protein  37.99 
 
 
303 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1561  thioesterase domain-containing protein  37.99 
 
 
291 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  37.55 
 
 
280 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  38.5 
 
 
248 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  36 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.86 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  35.98 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  35.71 
 
 
239 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  35.71 
 
 
239 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  37 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2428  thioesterase  39.09 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79067  hitchhiker  0.00311284 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  35.56 
 
 
284 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2147  pyochelin biosynthetic protein  35.8 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00348724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0873  pyochelin biosynthetic protein PchC  35.8 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0783  pyochelin biosynthetic protein PchC  35.8 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.57 
 
 
240 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  29.44 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  28.32 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.74 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  34.33 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  33.62 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3749  Thioesterase  35.11 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.501691  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.18 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  34.33 
 
 
251 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  29.13 
 
 
240 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1970  putative thiesterase family protein  33.18 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2512  Thioesterase  29.28 
 
 
236 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  28.82 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  28.76 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  34.1 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  34.05 
 
 
245 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  30.17 
 
 
242 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  34.21 
 
 
254 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  33.47 
 
 
257 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1831  pyochelin biosynthetic protein  33.75 
 
 
257 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  35.42 
 
 
2792 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54910  putative thioesterase  33.47 
 
 
271 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1779  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  26.87 
 
 
239 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  32.92 
 
 
249 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  32.61 
 
 
236 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3366  thioesterase  32.94 
 
 
257 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5001  thioesterase  32.94 
 
 
257 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0435421  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5286  thioesterase  33.06 
 
 
257 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0605968  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7295  thioesterase  33.93 
 
 
264 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0578517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  30.54 
 
 
249 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  33.77 
 
 
254 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0687  putative thioesterase  29.33 
 
 
254 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3448  Thioesterase  33.19 
 
 
264 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0755  thioesterase  29.33 
 
 
254 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  29.49 
 
 
250 aa  102  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4323  Thioesterase  37.07 
 
 
249 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0025  type II thioesterase, CesT  28.84 
 
 
237 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  31.92 
 
 
248 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.58 
 
 
2839 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.58 
 
 
2832 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.58 
 
 
2839 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  34.58 
 
 
2832 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>