186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6056 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  100 
 
 		 284 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  95.88 
 
 		 267 aa  507  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  42.11 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  34.17 
 
 		 259 aa  153  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  33.33 
 
 		 242 aa  148  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  38.79 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  38.79 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  35.09 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.83 
 
 		 256 aa  145  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  39.32 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  32.14 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.09 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  38.27 
 
 		 250 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  38.43 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.96 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.26 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  39.55 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.51 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.31 
 
 		 1337 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  39.24 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.51 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  32.61 
 
 		 258 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  29.44 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  38.82 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  33.04 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  38.82 
 
 		 251 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2147  pyochelin biosynthetic protein  38.16 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00348724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  39.13 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.41 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0873  pyochelin biosynthetic protein PchC  38.16 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0783  pyochelin biosynthetic protein PchC  38.16 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5286  thioesterase  38.46 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0605968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  39.57 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3366  thioesterase  38.03 
 
 		 257 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5001  thioesterase  38.03 
 
 		 257 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0435421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.7 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  29.6 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  38.7 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  38.7 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  38.7 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.9 
 
 		 250 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.58 
 
 		 242 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  30.38 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2122  linear gramicidin dehydrogenase LgrE  34.84 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  35.97 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  37.39 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1831  pyochelin biosynthetic protein  36.21 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0404  thioesterase domain-containing protein  36.74 
 
 		 259 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  36.05 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.9 
 
 		 253 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  30.77 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2512  Thioesterase  28.26 
 
 		 236 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1333  Thioesterase  33.79 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  36.24 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0755  thioesterase  32.89 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0687  putative thioesterase  32.89 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.08 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  38.36 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1970  putative thiesterase family protein  34 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  40.43 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  36.24 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  34.15 
 
 		 829 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3099  Thioesterase  29.39 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.33 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.59 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  36.24 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.33 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3223  thioesterase domain-containing protein  35.81 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0645  thioesterase domain-containing protein  35.81 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  34.91 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0198  thioesterase domain-containing protein  35.81 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1395  thioesterase domain-containing protein  35.81 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.397632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0462  thioesterase domain-containing protein  35.81 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  34.91 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0481  thioesterase domain-containing protein  35.81 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  37.72 
 
 		 239 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  34.91 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2821  thioesterase domain-containing protein  35.81 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  27.39 
 
 		 235 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  36.13 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  27.8 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3969  Thioesterase  32.03 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3448  Thioesterase  32.88 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2099  thioesterase  28.83 
 
 		 239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  31.71 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2296  Thioesterase  36.36 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  36.68 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  36.68 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2828  thioesterase  32.54 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  34.48 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  28.38 
 
 		 250 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5687  thioesterase  34.29 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0638728 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  31.9 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  32.6 
 
 		 252 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.16 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.59 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  29.71 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  32.4 
 
 		 832 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.33 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  32.59 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>