202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6482 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  100 
 
 		 281 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  35.5 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  45.18 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  39.81 
 
 		 252 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.57 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.71 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.99 
 
 		 1337 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.61 
 
 		 291 aa  158  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.66 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.66 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  36.84 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  32.76 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.57 
 
 		 250 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.79 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  38.26 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  42.25 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  39.91 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  39.08 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  32.33 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1333  Thioesterase  37.79 
 
 		 247 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  41.07 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  38.66 
 
 		 248 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.68 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.55 
 
 		 242 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  34.19 
 
 		 240 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  31.9 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  38.33 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  38.86 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  34.48 
 
 		 240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  36.36 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.41 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  37.44 
 
 		 829 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  32.64 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.87 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.56 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.33 
 
 		 240 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2512  Thioesterase  29.54 
 
 		 236 aa  132  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.62 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.44 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.28 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  35.71 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3863  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.45 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  35.84 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2122  linear gramicidin dehydrogenase LgrE  36.84 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4759  thioesterase  36.44 
 
 		 247 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  35.81 
 
 		 252 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1779  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.33 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140397  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  36.93 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  36.93 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  36.93 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1970  putative thiesterase family protein  36.99 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  36.52 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  36.1 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  36.91 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4690  CFA synthetase, thioesterase component  34.87 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  37.33 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  37.33 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  33.33 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  37.33 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  37.33 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2828  thioesterase  35.16 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54910  putative thioesterase  34.55 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  33.04 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  35.95 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1758  Thioesterase  33.91 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  hitchhiker  0.00873666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  35.93 
 
 		 239 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  36.41 
 
 		 248 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  35.93 
 
 		 239 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  36.36 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0025  type II thioesterase, CesT  34.55 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  35.8 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  34.1 
 
 		 1354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33270  PvdG  35.02 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275002  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3448  Thioesterase  36.71 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.32 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  39.44 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3749  Thioesterase  33.76 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.501691  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5687  thioesterase  35.29 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0638728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.81 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  36.48 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  32.27 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  36.48 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  35.86 
 
 		 832 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1834  thioesterase  34.21 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.80691  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  37.61 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5926  thioesterase  36.16 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.023654  normal  0.0208655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  33.33 
 
 		 2125 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  28.7 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  33.76 
 
 		 247 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0161  thioesterase  40 
 
 		 436 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  37.16 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  33.77 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4057  Thioesterase  31.3 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  29.31 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0133  putative thioesterase  33.77 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.94 
 
 		 2792 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3848  thioesterase  31.56 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1642  thioesterase domain-containing protein  33.77 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1561  thioesterase domain-containing protein  33.77 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  34.84 
 
 		 2832 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>