184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25620 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  100 
 
 
248 aa  501  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  67.66 
 
 
245 aa  332  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  69.4 
 
 
239 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  68.51 
 
 
239 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  68.1 
 
 
239 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  68.1 
 
 
239 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  64.22 
 
 
254 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  63.76 
 
 
254 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  58.97 
 
 
252 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  58.55 
 
 
248 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2828  thioesterase  50.85 
 
 
254 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33270  PvdG  50 
 
 
254 aa  221  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275002  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1834  thioesterase  47.21 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.80691  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3749  Thioesterase  43.67 
 
 
246 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.501691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4759  thioesterase  44.1 
 
 
247 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.39 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.39 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.08 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.74 
 
 
278 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  42.37 
 
 
280 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  42.37 
 
 
280 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  42.37 
 
 
280 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  40.43 
 
 
258 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  40.79 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  41.53 
 
 
280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.06 
 
 
1337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  41.48 
 
 
236 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  33.77 
 
 
235 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  39.11 
 
 
259 aa  159  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  33.89 
 
 
242 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  32.92 
 
 
240 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  36.4 
 
 
278 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.61 
 
 
281 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.26 
 
 
246 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.42 
 
 
261 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3735  thioesterase  42.68 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366799  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  39.13 
 
 
260 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.23 
 
 
255 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  39.17 
 
 
260 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  40.17 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  38.7 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  38.7 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  38.7 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3421  Thioesterase  33.91 
 
 
228 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00113491  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  39.32 
 
 
284 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  36.05 
 
 
271 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.81 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  38.82 
 
 
264 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.66 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  30.77 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1085  hypothetical protein  45.14 
 
 
172 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.742128  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.5 
 
 
267 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  35.96 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  36.57 
 
 
247 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  32.61 
 
 
253 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.6 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  38.26 
 
 
250 aa  135  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  31.49 
 
 
240 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  33.48 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.75 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  35.02 
 
 
1354 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2428  thioesterase  42.13 
 
 
254 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79067  hitchhiker  0.00311284 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2512  Thioesterase  30.08 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.09 
 
 
242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  37 
 
 
259 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4690  CFA synthetase, thioesterase component  34.05 
 
 
247 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  34.35 
 
 
249 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1970  putative thiesterase family protein  37.55 
 
 
254 aa  131  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1779  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.62 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140397  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  37.07 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.21 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.62 
 
 
253 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4057  Thioesterase  34.53 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  31.98 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.12 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  36.64 
 
 
251 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  37.23 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  34.6 
 
 
832 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3448  Thioesterase  36.52 
 
 
264 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  29.66 
 
 
250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  38.16 
 
 
280 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0133  putative thioesterase  37.28 
 
 
291 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1642  thioesterase domain-containing protein  37.28 
 
 
303 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1561  thioesterase domain-containing protein  37.28 
 
 
291 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7295  thioesterase  38.57 
 
 
264 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0578517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.06 
 
 
291 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  32.51 
 
 
258 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  34.63 
 
 
2125 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0025  type II thioesterase, CesT  31.3 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  32.02 
 
 
257 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  35.19 
 
 
245 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1333  Thioesterase  30.3 
 
 
247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3099  Thioesterase  30.49 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  34.56 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54910  putative thioesterase  35.25 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.04 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3863  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.76 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181058  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2122  linear gramicidin dehydrogenase LgrE  32.16 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5926  thioesterase  33.63 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.023654  normal  0.0208655 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1932b  thioesterase  29.66 
 
 
481 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>