170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3421 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3421  Thioesterase  100 
 
 
228 aa  472  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00113491  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  43.04 
 
 
242 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  37.72 
 
 
240 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  38.16 
 
 
240 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  33.91 
 
 
248 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.61 
 
 
240 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  35.96 
 
 
240 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  30.87 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  35.62 
 
 
239 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.7 
 
 
250 aa  134  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  35.71 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1779  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.96 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  29.91 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  33.18 
 
 
239 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.39 
 
 
278 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  30.53 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  33.49 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  33.48 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.89 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  33.19 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  34.5 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  30.3 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  31.8 
 
 
239 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  31.8 
 
 
239 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  33.64 
 
 
248 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2099  thioesterase  34.35 
 
 
239 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  32.24 
 
 
251 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  35.27 
 
 
248 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  29.44 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.96 
 
 
1337 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2512  Thioesterase  29.31 
 
 
236 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  31.78 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  32.08 
 
 
259 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.49 
 
 
261 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33270  PvdG  29.2 
 
 
254 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275002  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.84 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0025  type II thioesterase, CesT  32.43 
 
 
237 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2122  linear gramicidin dehydrogenase LgrE  30.77 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.79 
 
 
256 aa  114  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.38 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  30.26 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.55 
 
 
291 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  27.43 
 
 
278 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  29.67 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.52 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  29.96 
 
 
236 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4690  CFA synthetase, thioesterase component  29.2 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2828  thioesterase  29.57 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  33.19 
 
 
264 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  31.11 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.74 
 
 
251 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.74 
 
 
251 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  29.39 
 
 
260 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  27.19 
 
 
280 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  29.39 
 
 
265 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  29.39 
 
 
265 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  27.78 
 
 
271 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1333  Thioesterase  28.63 
 
 
247 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.89 
 
 
242 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.95 
 
 
255 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  34.6 
 
 
829 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.47 
 
 
246 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1970  putative thiesterase family protein  30.8 
 
 
254 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  32.73 
 
 
832 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1834  thioesterase  28.44 
 
 
253 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.80691  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  26.32 
 
 
280 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  26.32 
 
 
280 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  26.32 
 
 
280 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  31.78 
 
 
257 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.26 
 
 
281 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  34.64 
 
 
245 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3749  Thioesterase  28.19 
 
 
246 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.501691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  30.77 
 
 
2839 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  30.77 
 
 
2832 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  27.95 
 
 
267 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  30.77 
 
 
2839 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  30.77 
 
 
2832 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  29.13 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  29.13 
 
 
284 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.69 
 
 
250 aa  98.6  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  27.56 
 
 
249 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  28.24 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  30.32 
 
 
2835 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  31.13 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  30.19 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  27.51 
 
 
259 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2296  Thioesterase  31.44 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  28.8 
 
 
1354 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4759  thioesterase  25.66 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  30.81 
 
 
266 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  26.43 
 
 
249 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7295  thioesterase  36.97 
 
 
264 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0578517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2428  thioesterase  30.41 
 
 
254 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79067  hitchhiker  0.00311284 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0133  putative thioesterase  30 
 
 
291 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1642  thioesterase domain-containing protein  30 
 
 
303 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1561  thioesterase domain-containing protein  30 
 
 
291 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2095  yersiniabactin biosynthesis thioesterase YbtT  29.86 
 
 
267 aa  92.8  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  30 
 
 
280 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3848  thioesterase  27.35 
 
 
247 aa  92  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335198  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  30.32 
 
 
2792 aa  92  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>