174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5687 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5687  thioesterase  100 
 
 
256 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0638728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  35.32 
 
 
252 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.13 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.27 
 
 
250 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  42.27 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.74 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.95 
 
 
253 aa  138  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  40.91 
 
 
266 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  38.57 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  32.35 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  37 
 
 
251 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  37.67 
 
 
280 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  37.67 
 
 
280 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  37.67 
 
 
280 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  37 
 
 
251 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.61 
 
 
1337 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.5 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.8 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.8 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.19 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  27.78 
 
 
240 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.07 
 
 
240 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.08 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  32.62 
 
 
258 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  35.56 
 
 
257 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  27.63 
 
 
240 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  34.38 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  35.35 
 
 
258 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.55 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  33.75 
 
 
278 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  25.96 
 
 
240 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2122  linear gramicidin dehydrogenase LgrE  34.93 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.29 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  38.11 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.47 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  27.85 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35 
 
 
291 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  35.27 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  35.27 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  35.27 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  28.63 
 
 
278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.5 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  37.75 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  35.02 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  34.55 
 
 
267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  37.25 
 
 
251 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  32.78 
 
 
271 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  34.75 
 
 
829 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0161  thioesterase  37.1 
 
 
436 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  35.27 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  34.86 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  29.22 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  34.02 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.57 
 
 
274 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5926  thioesterase  35.65 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.023654  normal  0.0208655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  38.22 
 
 
248 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4690  CFA synthetase, thioesterase component  31.69 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1758  Thioesterase  34.72 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  hitchhiker  0.00873666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  31.58 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  29.39 
 
 
249 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  35.4 
 
 
2792 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  30.32 
 
 
250 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0527  Thioesterase  33.78 
 
 
268 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224136  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  35.11 
 
 
2835 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.44 
 
 
267 aa  105  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  32.64 
 
 
249 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.22 
 
 
2839 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.22 
 
 
2832 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3863  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.92 
 
 
260 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181058  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  34.22 
 
 
2839 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1970  putative thiesterase family protein  30.93 
 
 
254 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  34.22 
 
 
2832 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  35.19 
 
 
236 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4057  Thioesterase  36.13 
 
 
259 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  32.49 
 
 
248 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  29.41 
 
 
1354 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2512  Thioesterase  25.73 
 
 
236 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  26.18 
 
 
242 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2451  thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis-like  31.48 
 
 
261 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904446  normal  0.835593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  32.2 
 
 
245 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0481  thioesterase domain-containing protein  31.2 
 
 
259 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3223  thioesterase domain-containing protein  31.2 
 
 
259 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0462  thioesterase domain-containing protein  31.2 
 
 
259 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2821  thioesterase domain-containing protein  31.2 
 
 
259 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0645  thioesterase domain-containing protein  31.2 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0198  thioesterase domain-containing protein  31.2 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1395  thioesterase domain-containing protein  31.2 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.397632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  34.89 
 
 
2125 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0687  putative thioesterase  30.64 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0404  thioesterase domain-containing protein  33.33 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0755  thioesterase  30.21 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54910  putative thioesterase  32.11 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.74 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3475  Thioesterase  32.93 
 
 
269 aa  96.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3448  Thioesterase  31.33 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  35.84 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2147  pyochelin biosynthetic protein  35.91 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00348724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0873  pyochelin biosynthetic protein PchC  35.91 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0783  pyochelin biosynthetic protein PchC  35.91 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2296  Thioesterase  31.63 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>