163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2451 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2451  thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis-like  100 
 
 		 261 aa  543  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904446  normal  0.835593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.16 
 
 		 1337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  27.75 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.48 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  26.86 
 
 		 251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  26.86 
 
 		 251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  29.74 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  31.53 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0755  thioesterase  26.16 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  32.05 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0687  putative thioesterase  26.16 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  26.67 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  25.83 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.07 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  27.95 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.16 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1831  pyochelin biosynthetic protein  28.38 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5286  thioesterase  28.26 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0605968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5687  thioesterase  31.48 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0638728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.35 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  26.52 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  27.16 
 
 		 249 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2147  pyochelin biosynthetic protein  28.38 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00348724  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0783  pyochelin biosynthetic protein PchC  28.38 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0873  pyochelin biosynthetic protein PchC  28.38 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  32.08 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.52 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  27.95 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  27.75 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3366  thioesterase  29.11 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5001  thioesterase  29.11 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0435421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  31.28 
 
 		 832 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3863  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  26.96 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  27.65 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  27.75 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.27 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  27.75 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  27.75 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.54 
 
 		 278 aa  92  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  27.7 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1758  Thioesterase  28.77 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  hitchhiker  0.00873666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  24.57 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4712  coronamic acid synthetase, thioesterase component  29.11 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  27.6 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7295  thioesterase  26.17 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0578517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  25.46 
 
 		 245 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  26.29 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  25.39 
 
 		 259 aa  89.7  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  27.07 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  26.29 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2428  thioesterase  28.94 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79067  hitchhiker  0.00311284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  26.81 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  27 
 
 		 829 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  24.42 
 
 		 240 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  24.29 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  27.73 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  27.9 
 
 		 280 aa  85.5  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0133  putative thioesterase  27.9 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  27.73 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1642  thioesterase domain-containing protein  27.9 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1561  thioesterase domain-containing protein  27.9 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  22.54 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  26.15 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  25.57 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.38 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  25 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  26.56 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  23.96 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  25.94 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.52 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  27.07 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5926  thioesterase  26.22 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.023654  normal  0.0208655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  23.5 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  27.69 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  25.94 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  24.47 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3969  Thioesterase  25.76 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  21.85 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  25.42 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1932b  thioesterase  28.05 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  25.68 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  26.38 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.39 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  23.4 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  23.61 
 
 		 1354 aa  75.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  24.17 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  24.17 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  24.17 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2122  linear gramicidin dehydrogenase LgrE  27.14 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  25.88 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4057  Thioesterase  28.25 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  22.98 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  24.41 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  24.68 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  26.81 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4690  CFA synthetase, thioesterase component  22.88 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1779  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  24.41 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3448  Thioesterase  24.44 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0161  thioesterase  27.6 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>