182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4712 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4712  coronamic acid synthetase, thioesterase component  100 
 
 		 253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  32.56 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  32.08 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  29.57 
 
 		 1354 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.18 
 
 		 281 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  27.75 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.22 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.55 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.18 
 
 		 1337 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.33 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.69 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  31.43 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.32 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.63 
 
 		 250 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  32.14 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  29.78 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  31.78 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.75 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.7 
 
 		 278 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2428  thioesterase  31.7 
 
 		 254 aa  95.5  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79067  hitchhiker  0.00311284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  26.72 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  33.19 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  33.64 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.66 
 
 		 256 aa  91.7  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  33.19 
 
 		 280 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1333  Thioesterase  25.81 
 
 		 247 aa  92  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  33.19 
 
 		 280 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  33.19 
 
 		 280 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  27.12 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.57 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  33.64 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.57 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4690  CFA synthetase, thioesterase component  31.31 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2451  thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis-like  29.11 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904446  normal  0.835593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.39 
 
 		 291 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5926  thioesterase  29.57 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.023654  normal  0.0208655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2122  linear gramicidin dehydrogenase LgrE  29.96 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54910  putative thioesterase  30 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3969  Thioesterase  29.75 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  33.48 
 
 		 267 aa  88.6  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  33.63 
 
 		 284 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  28.76 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  25.75 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  34.35 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5687  thioesterase  32.71 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0638728 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  26.5 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1932b  thioesterase  29.15 
 
 		 481 aa  86.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4057  Thioesterase  32.77 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1834  thioesterase  28.82 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.80691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  29.82 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1758  Thioesterase  29.67 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  hitchhiker  0.00873666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2512  Thioesterase  25.35 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  25.64 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  30.43 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  26.36 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  29.72 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3863  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.44 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  33.04 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  32.52 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  29.39 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4323  Thioesterase  30.21 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3448  Thioesterase  29.95 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3749  Thioesterase  29.96 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.501691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.24 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0630  Thioesterase  30 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  30.37 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  28.81 
 
 		 832 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  27.6 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2316  thioesterase II  30.28 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0766972  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  27.73 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  27.73 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  29.05 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  25.11 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.9 
 
 		 2125 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  30 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1970  putative thiesterase family protein  27.51 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.28 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3475  Thioesterase  26.64 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  28.57 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3099  Thioesterase  30.32 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  29.55 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  24.66 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  30.09 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  29.09 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  24.26 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4759  thioesterase  29.03 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2828  thioesterase  28.64 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5776  thioesterase  29.31 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  28.45 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  28.4 
 
 		 829 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  29.86 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0133  putative thioesterase  28.45 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  29.44 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1642  thioesterase domain-containing protein  28.45 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1561  thioesterase domain-containing protein  28.45 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.04 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.57 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  31.54 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2433  thioesterase  29.13 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.823323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33270  PvdG  29.11 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275002  normal  0.084061 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>