More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1113 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  100 
 
 		 319 aa  649    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0242  hypothetical protein  30.19 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0241  hypothetical protein  30.88 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  48.11 
 
 		 347 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  45.22 
 
 		 270 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 258 aa  90.1  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  34.26 
 
 		 832 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  40.61 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  34.64 
 
 		 829 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0228  Methyltransferase type 11  39.68 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  33.84 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  38.81 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.23 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  41.05 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.23 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.21 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  31.69 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  34.23 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 634 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.16 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  34.23 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.14 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  36.27 
 
 		 202 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.42 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.27 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.19 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 214 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  39.09 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  43.27 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.54 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.54 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.22 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  35.51 
 
 		 168 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.14 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 201 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  39.17 
 
 		 187 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 199 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.43 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.21 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  35.35 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  29.31 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  32.14 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  39.36 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  43 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.74 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.38 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.36 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.86 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  27.84 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  26.36 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.86 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  36.21 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  36.89 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  33.87 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 266 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  35 
 
 		 392 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.23 
 
 		 249 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.65 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.88 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.31 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  30.41 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  30.98 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.38 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>