More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0984 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  100 
 
 
300 aa  598  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  53.29 
 
 
292 aa  312  3.9999999999999997e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  52.6 
 
 
292 aa  311  6.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  53.63 
 
 
313 aa  308  5e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  54.42 
 
 
296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  52.6 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.89 
 
 
282 aa  93.2  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  30 
 
 
278 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0997  methyltransferase type 11  27.39 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.698305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  36.31 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  39.88 
 
 
237 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.07 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  33.54 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  35.46 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  33.73 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.94 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  34.36 
 
 
832 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.35 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.53 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  35.88 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  39.04 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2870  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.15 
 
 
482 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24578  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  31.22 
 
 
241 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.37 
 
 
494 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  40.68 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  40.19 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  38.4 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.14 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.58 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  42.31 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.4 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  27.57 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 
258 aa  67  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
1012 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  33.1 
 
 
229 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  31.28 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  32.77 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  30.94 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
220 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4216  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.23 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0228  Methyltransferase type 11  32.51 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.59 
 
 
232 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.97 
 
 
266 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4606  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.61 
 
 
442 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  hitchhiker  0.0000312822 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  42.22 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  37.27 
 
 
409 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12710  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.17 
 
 
198 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.64 
 
 
237 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 
251 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 
251 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4250  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 
251 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 
251 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  28.72 
 
 
262 aa  63.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 
251 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
262 aa  62.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
411 aa  63.2  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.01 
 
 
280 aa  62.8  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  36.03 
 
 
263 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  35.2 
 
 
273 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  41.35 
 
 
187 aa  62.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
293 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.35 
 
 
251 aa  62.4  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.69 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  27.69 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  32.77 
 
 
233 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  29.56 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  29.01 
 
 
225 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
283 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.57 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.03 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0977  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.45 
 
 
243 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1838  cyclopropane fatty acid synthase  25 
 
 
434 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28.45 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.32 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.4 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
258 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.32 
 
 
223 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.01 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>