More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0725 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 313 aa  645    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  94.59 
 
 		 296 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  90.54 
 
 		 296 aa  552  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  80.48 
 
 		 292 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  80.82 
 
 		 292 aa  493  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  53.63 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 295 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  34.9 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0997  methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.698305 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  35.15 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.93 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  24.42 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  25.36 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.93 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.94 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.17 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.78 
 
 		 248 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  33.96 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.17 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 1012 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.33 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.86 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  30.64 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.04 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 246 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.64 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.34 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  28.73 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.33 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  33.64 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.98 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  34.95 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  27.17 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.93 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.52 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.88 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2642  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  30.12 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.94 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  26.84 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.32 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0228  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 246 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  30.77 
 
 		 233 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  27.49 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2303  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342078  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1636  methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  30.54 
 
 		 832 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  30.86 
 
 		 829 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  28.21 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  28.21 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  38.26 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  23.4 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  33.94 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>