More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1112 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  100 
 
 
246 aa  498  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.27 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
1106 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 
296 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  25.64 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  36.97 
 
 
296 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  29.81 
 
 
233 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 
313 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
244 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  25.29 
 
 
267 aa  62  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3341  methyltransferase type 11  26.96 
 
 
315 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3574  methyltransferase type 11  28.86 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  26.99 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  23.98 
 
 
210 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  26.21 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  26.01 
 
 
293 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  26.9 
 
 
295 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 
248 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.38 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.38 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.27 
 
 
213 aa  59.7  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
292 aa  59.3  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.4 
 
 
283 aa  58.9  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  24.83 
 
 
248 aa  58.9  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.38 
 
 
256 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  30.12 
 
 
353 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.38 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  27.17 
 
 
292 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  30.84 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  30.54 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 
353 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  26.61 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1423  methyltransferase type 11  26.88 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.86 
 
 
345 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
208 aa  57  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.97 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 
283 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  26.35 
 
 
244 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  32.65 
 
 
208 aa  56.2  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
225 aa  55.8  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  31.25 
 
 
290 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3993  hypothetical protein  33.04 
 
 
292 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  35 
 
 
281 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  31.25 
 
 
290 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  25.68 
 
 
240 aa  56.2  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  31.25 
 
 
290 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.43 
 
 
256 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  31.25 
 
 
290 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  23.24 
 
 
232 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  28.93 
 
 
253 aa  55.8  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  28.93 
 
 
253 aa  55.8  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  26.75 
 
 
283 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  31.97 
 
 
191 aa  55.5  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3407  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  25.69 
 
 
322 aa  55.1  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
710 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3714  hypothetical protein  25.69 
 
 
315 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000001291  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39860  methylase  29.25 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3444  hypothetical protein  25.69 
 
 
322 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000102357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
292 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  25.52 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  34 
 
 
629 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  24.68 
 
 
315 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
711 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  27.55 
 
 
204 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  24.83 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2231  methyltransferase type 11  34.86 
 
 
214 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  29.17 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  26.75 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.37 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  25.45 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
363 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  31.43 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1110  hypothetical protein  28.57 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  26.35 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 
634 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  23.29 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
202 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  23.7 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  24.1 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  29 
 
 
202 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  24.14 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.66 
 
 
258 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  25.34 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  28.68 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  27.52 
 
 
318 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>