More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3984 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  100 
 
 		 245 aa  512  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  71.43 
 
 		 244 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.41 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 354 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  30.14 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  30.14 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  30.23 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 307 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  36.7 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  39.62 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.75 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  32.38 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  32.38 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  32.38 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  32.38 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  32.38 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  32.38 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.31 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  32.38 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  32.38 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 2490 aa  58.5  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.04 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  31.62 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  32.35 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  38.53 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  33.81 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  32.35 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  24.81 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  33.98 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 1759 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.11 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  23.68 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.11 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  27.2 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1674  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  31.67 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  24.48 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  30.88 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 1106 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  31.67 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  29.91 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  29.5 
 
 		 577 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  32.69 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  21.94 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.79 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  29.77 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  29.91 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.37 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3585  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0121  methyltransferase type 12  22.49 
 
 		 330 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.333152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  28.34 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  28.47 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.33 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 352 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.96 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  29.91 
 
 		 290 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9446  predicted protein  34.34 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3033  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 304 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.91 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.74 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  34.91 
 
 		 312 aa  53.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  29.13 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.740234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>