More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2918 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  100 
 
 
248 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  67.61 
 
 
264 aa  332  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  65.73 
 
 
263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  66.94 
 
 
259 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  66.12 
 
 
259 aa  310  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  66.12 
 
 
259 aa  310  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  61.45 
 
 
261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  60.98 
 
 
274 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  61.16 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  58.67 
 
 
258 aa  255  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  43.79 
 
 
1106 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  36.41 
 
 
257 aa  111  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
255 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  37.96 
 
 
261 aa  89.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  36.64 
 
 
1032 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  39.33 
 
 
634 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  32.4 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  32.06 
 
 
885 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  31.01 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
208 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  38.81 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  30.68 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  33.78 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  34.68 
 
 
870 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.37 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.9 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  29.41 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  35.19 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 
225 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2514  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.775917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  39.36 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  40.43 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  31.25 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.9 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.71 
 
 
345 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  34.29 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.35 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  38.33 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  38.33 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  30.41 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.34 
 
 
255 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  42.11 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  38.54 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.7 
 
 
262 aa  62.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  32.68 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  41.49 
 
 
260 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
237 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.52 
 
 
229 aa  62.4  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 
244 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  31.45 
 
 
233 aa  62  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  28.76 
 
 
237 aa  62  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.29 
 
 
268 aa  62  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26 
 
 
303 aa  62  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3215  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  33.03 
 
 
320 aa  62  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.409549  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
247 aa  62  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  28.74 
 
 
287 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
279 aa  62  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  31.43 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  30.97 
 
 
400 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.34 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2520  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.37 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.783143  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  41.96 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
208 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  39.83 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  39.83 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0134  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.34 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200688  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.34 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  38.78 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  30.67 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  34.78 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  25 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
210 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  36.28 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.65 
 
 
230 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  36.19 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  30 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
316 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  31.29 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  30.67 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  30.77 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  39.8 
 
 
242 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>