More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2269 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  100 
 
 		 240 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 211 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.93 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  25.93 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  28.26 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  29.84 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.86 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.86 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.86 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.8 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.8 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.13 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.8 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.86 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  28.89 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  29.77 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.86 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.8 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.83 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.86 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.77 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  31.82 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  30.97 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  27.05 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  28.41 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 187 aa  67  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  38.05 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  29.08 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  33.63 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 1002 aa  65.5  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.56 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.81 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  32 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 		 634 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  31.78 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.74 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.34 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  27.52 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.45 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  32.77 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.34 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46770  predicted protein  31.9 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2069  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0598804  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2086  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0379374  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  26.12 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2132  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0115408 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.85 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  26.85 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.74 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.74 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.85 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 1000 aa  62.4  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.85 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.85 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  37.5 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 272 aa  62  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 248 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.74 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>