More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1559 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  54.63 
 
 		 282 aa  218  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  44.34 
 
 		 295 aa  141  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  41.86 
 
 		 295 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  33.18 
 
 		 278 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  39.88 
 
 		 263 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 282 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  42.72 
 
 		 261 aa  88.2  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  38.4 
 
 		 271 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.57 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 328 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  41.35 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 296 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  41.9 
 
 		 258 aa  72  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  26.91 
 
 		 342 aa  72  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 296 aa  71.6  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 313 aa  71.2  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.78 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 283 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  37.61 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  31.8 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  33.02 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  35.24 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  39.81 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  37.86 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  38.83 
 
 		 311 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  32.35 
 
 		 392 aa  65.5  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  33 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  40 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  37.37 
 
 		 365 aa  64.7  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  37.86 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  40.78 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  34 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  26.92 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2783  Methyltransferase type 11  46.07 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  39.81 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  39.68 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  36.89 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  36.89 
 
 		 311 aa  62  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 298 aa  61.6  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  36.36 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  34.95 
 
 		 304 aa  61.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  36.27 
 
 		 832 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  38 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  30.77 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  36.89 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  20.71 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  34.19 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  28.85 
 
 		 377 aa  58.9  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  33.04 
 
 		 829 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.26 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  31.33 
 
 		 294 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  34.29 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  39.37 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  25.9 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  32.11 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  33.33 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  31.15 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  41.58 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>