More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0028 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 710 aa  1443    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  88.19 
 
 		 711 aa  1259    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1120  glycosyl transferase group 1  54.16 
 
 		 386 aa  418  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  47 
 
 		 293 aa  273  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0966  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 382 aa  254  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0155699  normal  0.836168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1772  group 1 glycosyl transferase  33.07 
 
 		 392 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2374  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 		 373 aa  144  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 385 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 367 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 396 aa  94.4  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 391 aa  92.8  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 		 389 aa  89.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 		 393 aa  88.6  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 373 aa  87.4  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3062  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147166  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  28.42 
 
 		 935 aa  82.4  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  26.82 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25 
 
 		 346 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 419 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 394 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 672 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 364 aa  79.7  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  35.23 
 
 		 241 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  42.24 
 
 		 238 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  41.88 
 
 		 240 aa  78.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  42.02 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  41.07 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  33.16 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  41.07 
 
 		 237 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 371 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 390 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 241 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 377 aa  76.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1055  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.6 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  41.96 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  40 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  28.72 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  33.62 
 
 		 273 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  38.71 
 
 		 240 aa  73.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  28.21 
 
 		 638 aa  73.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 222 aa  72.4  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  30.73 
 
 		 363 aa  72  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  31.22 
 
 		 243 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  31.22 
 
 		 243 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  31.22 
 
 		 243 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 244 aa  72.4  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  33.1 
 
 		 168 aa  71.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 		 392 aa  72  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  32.18 
 
 		 415 aa  72  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 1080 aa  71.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  28.41 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  34.32 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 634 aa  71.2  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.13 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.13 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.13 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>