More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2138 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  100 
 
 
237 aa  480  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  62.45 
 
 
255 aa  308  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  59.32 
 
 
243 aa  304  8.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  59.07 
 
 
237 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  62.07 
 
 
289 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  58.4 
 
 
241 aa  293  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  59.07 
 
 
237 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  57.63 
 
 
243 aa  291  9e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  56.54 
 
 
241 aa  287  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  58.05 
 
 
241 aa  286  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  60.34 
 
 
251 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  59.32 
 
 
239 aa  272  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  56.96 
 
 
243 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  56.96 
 
 
243 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  56.96 
 
 
243 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  54.03 
 
 
249 aa  258  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  46.22 
 
 
238 aa  223  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  43.75 
 
 
240 aa  215  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  44.35 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  45.8 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  43.04 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  42.68 
 
 
222 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  31.93 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  29.29 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  29.34 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  36.09 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  41.07 
 
 
710 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  29.66 
 
 
311 aa  77  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  27.93 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  39.32 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  37.01 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  39.17 
 
 
711 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  39.83 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.92 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  41.53 
 
 
282 aa  75.1  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.06 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  27.31 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.64 
 
 
236 aa  71.6  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  26.42 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  37.1 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  34.59 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  27.12 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  39.09 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  40.32 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  38.66 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  27.47 
 
 
211 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  35.43 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  33.06 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.96 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.29 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  41.9 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  35.54 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  29.41 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.99 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.2 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  38.18 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  36.36 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.82 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  25.51 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  41.59 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  33.06 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  33.53 
 
 
417 aa  65.9  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  41.23 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  44.44 
 
 
280 aa  65.1  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4065  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal  0.0815821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  31.82 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0603  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000027512  unclonable  0.00000842033 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.92 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.1 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.84 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  27.75 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.52 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.22 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 
291 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  36.28 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  39.78 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.9 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  52.54 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.65 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.59 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>