More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2546 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  38.97 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  36.43 
 
 		 240 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  39.85 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 511 aa  92.4  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  42.74 
 
 		 242 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  26.12 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 706 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  30.95 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  38.67 
 
 		 1476 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  38.17 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3844  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.09 
 
 		 764 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  24.47 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 711 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.26 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  41.94 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.85 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2348  hypothetical protein  25.34 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 		 710 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  42.19 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 		 507 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  29.85 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  49.09 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.67 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  43.55 
 
 		 870 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  39.24 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  42.19 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  39.24 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  32 
 
 		 358 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.13 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 196 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 239 aa  53.1  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  34.21 
 
 		 233 aa  52.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_550  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.91 
 
 		 224 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00760121  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  37.68 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  32.26 
 
 		 233 aa  52.4  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 269 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  40.28 
 
 		 257 aa  52.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  25.98 
 
 		 239 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.67 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.36 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  35.19 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  34.17 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  37.5 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0777  methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.621905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7834  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  28.57 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  23.97 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  36.92 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3993  hypothetical protein  33 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0397  methyltransferase type 11  37.33 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  44.64 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  46.15 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  26.03 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  26.03 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  37.1 
 
 		 224 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.97 
 
 		 229 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  25.98 
 
 		 235 aa  49.7  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>