More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0854 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1562  SAM-dependent methyltransferase  37.99 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.595614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  39.29 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  36.1 
 
 		 241 aa  156  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  36.78 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.76 
 
 		 853 aa  148  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.76 
 
 		 853 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.51 
 
 		 851 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.51 
 
 		 851 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.51 
 
 		 851 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  36.51 
 
 		 851 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.51 
 
 		 851 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.93 
 
 		 853 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 		 750 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3600  methyltransferase type 11  38.25 
 
 		 293 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3029  hypothetical protein  32.88 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.635619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  34.71 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2547  glycosylase or SAM-dependent methyltransferase  32.23 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.999348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 		 461 aa  89.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0619  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  55.56 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  58 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  52.54 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  55.56 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  58 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  53.85 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 235 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  56.25 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  44.62 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  45.45 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  55.77 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  50 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  45.16 
 
 		 711 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  43.55 
 
 		 710 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  50 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  40.79 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  43.08 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  49.09 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  53.85 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  49.09 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  49.09 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  39.77 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  42.19 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  34.94 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  54 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  52.83 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  50.94 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  28.65 
 
 		 868 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  48.08 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  60.47 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  46.67 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  58.14 
 
 		 325 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5464  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  44.87 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  41.77 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 282 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  56.82 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 204 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  42.19 
 
 		 242 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  37.18 
 
 		 374 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.86 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0603  methyltransferase type 11  41.05 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000027512  unclonable  0.00000842033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  37.35 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  48.98 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4065  methyltransferase type 11  49.02 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal  0.0815821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  44.9 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.74 
 
 		 345 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  53.49 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  47.37 
 
 		 331 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  43.4 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0789  methyltransferase type 11  43.55 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  39.24 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.14 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.62 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  44.26 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  37.18 
 
 		 362 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  47.46 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  44.26 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  48.28 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  37.66 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>