More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2874 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  83.54 
 
 
237 aa  410  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  75.11 
 
 
255 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  72.46 
 
 
243 aa  363  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  71.19 
 
 
239 aa  341  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  63.16 
 
 
249 aa  316  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  62.71 
 
 
243 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  59.75 
 
 
241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  58.65 
 
 
241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  61.21 
 
 
289 aa  302  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  59.92 
 
 
241 aa  301  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  59.07 
 
 
237 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  59.07 
 
 
243 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  59.07 
 
 
243 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  59.07 
 
 
243 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  60.08 
 
 
251 aa  269  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  48.74 
 
 
238 aa  232  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  47.48 
 
 
238 aa  226  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  49.58 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  42.45 
 
 
239 aa  198  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  40.08 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  45.19 
 
 
222 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  29.96 
 
 
278 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  28.99 
 
 
276 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  27.54 
 
 
272 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  28.92 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  29.96 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  32.4 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  28.21 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  32.77 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  42 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.64 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  33.54 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0603  methyltransferase type 11  38.71 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000027512  unclonable  0.00000842033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  38.33 
 
 
710 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  26.92 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.42 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  31.98 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.82 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  36.18 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  27.66 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.82 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  35.83 
 
 
711 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.96 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  27.49 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.84 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 
276 aa  65.1  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  33.86 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
295 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  27.23 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  34.84 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  34.84 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2520  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.37 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.783143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.55 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530089  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  24.79 
 
 
294 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  29.06 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4065  methyltransferase type 11  30.06 
 
 
295 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal  0.0815821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  37.6 
 
 
228 aa  63.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  34.13 
 
 
254 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.11 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.76 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  41.03 
 
 
272 aa  63.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  38.18 
 
 
283 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  34.09 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.11 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  32.3 
 
 
256 aa  62.8  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  25.73 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.1 
 
 
274 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.52 
 
 
282 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  35.48 
 
 
233 aa  62.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  27.11 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  36.04 
 
 
274 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  40.18 
 
 
281 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  33.54 
 
 
256 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.16 
 
 
228 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 
248 aa  62  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.15 
 
 
237 aa  62  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  35.59 
 
 
310 aa  62  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
295 aa  62  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0757  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.35 
 
 
230 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  31.82 
 
 
240 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>