180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0533 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  100 
 
 
260 aa  531  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  86.78 
 
 
243 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  75.83 
 
 
272 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  51.12 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  39.91 
 
 
237 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  37.67 
 
 
237 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  31.11 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
531 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
527 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
527 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
519 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0397  Methyltransferase type 12  24.89 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0388  Methyltransferase type 12  24.89 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  27.35 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  25.47 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  27.66 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  31.51 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  27.44 
 
 
318 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
276 aa  62.4  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  28.11 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  25.56 
 
 
292 aa  59.7  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  38.55 
 
 
248 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  37.35 
 
 
248 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  37.35 
 
 
248 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  37.35 
 
 
248 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  30.61 
 
 
249 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
248 aa  58.9  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  31.37 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  29.86 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  30.43 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  27.36 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  27.36 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  27.36 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 
274 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 
251 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  28.68 
 
 
237 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  55.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  26.17 
 
 
311 aa  55.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  29.28 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 
711 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
710 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  31.62 
 
 
191 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  30.57 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  38.03 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  26.97 
 
 
207 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 
264 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  21.63 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  25.97 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  28.08 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  27.74 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3318  hypothetical protein  29.76 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  27.11 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  28.22 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  26.09 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  24.6 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  25.85 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  26.62 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  24.44 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  26.02 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  24.44 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  24.44 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  24.78 
 
 
238 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  24.68 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  26.43 
 
 
222 aa  48.9  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  27.33 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
283 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.79 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  25.61 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28.81 
 
 
374 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  24.78 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  30.21 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  28.17 
 
 
331 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  27.46 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.81 
 
 
362 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
261 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  27.42 
 
 
243 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.81 
 
 
373 aa  47  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  23.33 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  27.37 
 
 
206 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1700  methyltransferase type 12  25.74 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0251  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
165 aa  46.6  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.999818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  26.2 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  22.84 
 
 
323 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  26.45 
 
 
305 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  30.61 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.28 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  25.6 
 
 
273 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  30.34 
 
 
264 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3753  methyltransferase type 12  23.83 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.97 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  24.88 
 
 
238 aa  46.2  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>