144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2382 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  100 
 
 		 243 aa  502  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  41.8 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  41.32 
 
 		 248 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  41.32 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  40.91 
 
 		 248 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  38.33 
 
 		 244 aa  201  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  35.39 
 
 		 240 aa  168  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 254 aa  128  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  27.53 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  31 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  30.57 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  31.55 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  29.61 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 288 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 288 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  27.06 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  29.31 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  29.44 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  29.44 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  28.28 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  27.06 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  28.29 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  25.62 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  28.09 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  29.28 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  22.91 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  25.11 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 		 527 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0397  Methyltransferase type 12  32.59 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0388  Methyltransferase type 12  32.59 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 		 519 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  26.03 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 		 527 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 531 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  24.11 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  27.61 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  25.6 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  26.21 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  24.44 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  23.44 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  29.03 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  22.79 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.7 
 
 		 672 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0292  MCP methyltransferase, CheR-type  25.2 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  23.94 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6137  methyltransferase UbiE  26.06 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  27.74 
 
 		 358 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  26.35 
 
 		 336 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2551  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  27.01 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  25.5 
 
 		 354 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  27.67 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 272 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  21.63 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  24.79 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  23.49 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 282 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 313 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  27.43 
 
 		 298 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  24.06 
 
 		 305 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  25.24 
 
 		 310 aa  49.3  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  24.75 
 
 		 317 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  26.92 
 
 		 300 aa  48.5  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  27.86 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  26.34 
 
 		 305 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  23.6 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2729  Methyltransferase type 11  23.46 
 
 		 317 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  32.35 
 
 		 312 aa  46.6  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.04 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 		 711 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  29.07 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  23.21 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  27.63 
 
 		 308 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1141  methyltransferase type 11  26.23 
 
 		 236 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  27.68 
 
 		 240 aa  45.4  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  24.76 
 
 		 231 aa  45.4  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  22.09 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  29.56 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  25.28 
 
 		 396 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 318 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0448  methyltransferase type 12  18.42 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00834451  normal  0.0296348 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>