More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1490 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 288 aa  597  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  88.54 
 
 		 288 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  61.32 
 
 		 289 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  42.01 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6137  methyltransferase UbiE  35.89 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  39.15 
 
 		 318 aa  198  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  34.47 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  30.54 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  28.98 
 
 		 244 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  32.92 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  32.67 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  28 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  32.67 
 
 		 248 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  32.27 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  36.02 
 
 		 233 aa  86.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  31.75 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  32.39 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  26.34 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  30 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  29.64 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 274 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  32.91 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 		 531 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  27.83 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  27.37 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 		 527 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 		 527 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  32.26 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  32.92 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 519 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  32.84 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  32.84 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  30.83 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  30.83 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  30.83 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 710 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  28.37 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  34 
 
 		 268 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  28.91 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  31.97 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  31.62 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 		 711 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  28.68 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  27.08 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  24.83 
 
 		 230 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  25.83 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.42 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  26 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  30 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.19 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.67 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  41.94 
 
 		 240 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  40 
 
 		 237 aa  52.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  27.91 
 
 		 272 aa  52.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 		 457 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 417 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.35 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 204 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  25.63 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  31.62 
 
 		 390 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2551  Methyltransferase type 11  39.17 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.09 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>