117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0292 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0292  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
253 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  43.31 
 
 
255 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  36.8 
 
 
251 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
249 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
249 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.96 
 
 
261 aa  85.5  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  31.05 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  29.67 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  27.92 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  26.69 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  25.6 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  33 
 
 
185 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.18 
 
 
213 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  23.77 
 
 
311 aa  58.9  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  25.2 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
214 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  26.38 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
254 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  25.98 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  25.98 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  24.9 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  25.59 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
208 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  31.37 
 
 
296 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.21 
 
 
251 aa  48.5  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1784  Methyltransferase type 11  26.26 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4190  Methyltransferase type 12  31.97 
 
 
208 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278739  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  36.08 
 
 
1162 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0810  hypothetical protein  32.73 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1368  methyltransferase type 12  32.35 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
196 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0753  Methyltransferase type 11  28.41 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3645  DNA repair protein RadC  29.73 
 
 
198 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  30 
 
 
226 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  29.46 
 
 
209 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  29.1 
 
 
192 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.14 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0834  hypothetical protein  32.73 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  25.5 
 
 
219 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
305 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  31.31 
 
 
297 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  34.38 
 
 
1287 aa  45.8  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  28.21 
 
 
208 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.29 
 
 
261 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  32.38 
 
 
323 aa  45.4  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
219 aa  45.4  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  29.91 
 
 
254 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.69 
 
 
256 aa  45.4  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1892  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.08 
 
 
424 aa  45.4  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 
210 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  28.12 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0890  hypothetical protein  27.91 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  31.53 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2745  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 
482 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  23.92 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  29.46 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  32.08 
 
 
1085 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  25.44 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  30.43 
 
 
423 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  29.29 
 
 
415 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
710 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.37 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  31.48 
 
 
746 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  27.5 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.9 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  27.03 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  27.18 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.3 
 
 
236 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1319  methyltransferase type 12  30.25 
 
 
320 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6510  methyltransferase type 12  30.25 
 
 
320 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
1312 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  34 
 
 
198 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  30.92 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.25 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
194 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  29.81 
 
 
376 aa  43.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  25.77 
 
 
213 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.46 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  28.06 
 
 
201 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  22.6 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
540 aa  42.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 
304 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.37 
 
 
315 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  27.35 
 
 
290 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6101  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
320 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
195 aa  42.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 
317 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  29.91 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>