More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0630 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  54.2 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  39.52 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  36.43 
 
 		 280 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.89 
 
 		 764 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 511 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  38.84 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  37.31 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 706 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  44.78 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  39.74 
 
 		 1476 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1124 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 		 507 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1110  hypothetical protein  29.41 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.35 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  38.54 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  39.19 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 237 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  41.38 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  31.82 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  38.64 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3844  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  39.08 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2892  methyltransferase type 12  31.9 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  44.78 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  52.17 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  39.24 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 		 711 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  40.23 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 		 710 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  40.23 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  52.17 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.43 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  42.17 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  54 
 
 		 624 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  42.17 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  42.62 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  34.07 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7834  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 316 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  35.53 
 
 		 189 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  31.4 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  35.62 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  35 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3236  methyltransferase type 11  31.96 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  38.67 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.53 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.82 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 331 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 866 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 333 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.46 
 
 		 345 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  37.35 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  35.29 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  37.68 
 
 		 287 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  24.2 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  54.35 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  40 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  28.12 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  30.89 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.91 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>