85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08180 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  100 
 
 		 246 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  50.22 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  51.12 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  49.53 
 
 		 272 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 237 aa  118  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  34.93 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 531 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  30.13 
 
 		 251 aa  112  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 519 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 		 527 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 		 527 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0388  Methyltransferase type 12  27.8 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0397  Methyltransferase type 12  27.8 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  26.64 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  24 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  31.29 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  26.21 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  30.33 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  27.94 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  27.94 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  27.21 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  27.94 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  29.85 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  24.07 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  32.88 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  30.56 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  27.54 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  27.43 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  27.43 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  27.43 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  26.13 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3318  hypothetical protein  32.61 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  24.07 
 
 		 318 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  29.32 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  23.88 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2551  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  22.02 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 581 aa  51.6  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  27.11 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  25 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  27.27 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  21.2 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  27.27 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  29.03 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 710 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  28.85 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  29.63 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  22.89 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  25.17 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  30.82 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5473  Methyltransferase type 12  28 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2514  methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.775917 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 		 711 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0317  Methyltransferase type 12  32.17 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  23.39 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  23.88 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  26.29 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0093  methyltransferase type 12  28.23 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  normal  0.108853 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  26.41 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  22.38 
 
 		 310 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  29.22 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  22.3 
 
 		 396 aa  42.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 324 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  27.33 
 
 		 275 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  24.32 
 
 		 332 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4097  Methyltransferase type 11  29.95 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1700  methyltransferase type 12  28.03 
 
 		 274 aa  42  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>