258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3855 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 249 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  87.95 
 
 		 249 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0093  methyltransferase type 12  43.25 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  normal  0.108853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  31.62 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  36.02 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  30.98 
 
 		 237 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  30.98 
 
 		 237 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  30.98 
 
 		 237 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  30.86 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  30.86 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  34.54 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  32.61 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  35.15 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  39.05 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  28.26 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  40 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  39.05 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  36.81 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  38.1 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  35.1 
 
 		 263 aa  72  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  26.8 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  26.03 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  35.85 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  28.94 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  25.89 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  34.27 
 
 		 252 aa  62  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  35.83 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  29.55 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 		 527 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  30.43 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 		 527 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0388  Methyltransferase type 12  27 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0397  Methyltransferase type 12  27 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  30 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  35.14 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  32.33 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  30.13 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 519 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1052  Methyltransferase type 12  27.33 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  32.28 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 186 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  34.3 
 
 		 289 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  27.54 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  29.22 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.25 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.73 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.19 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 208 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.84 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  26.06 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.18 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.19 
 
 		 232 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  32 
 
 		 204 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.08 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.78 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.26 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.69 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  25.42 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  34.23 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  27.93 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  26 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  25.33 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  29.91 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.19 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0171  hypothetical protein  29.5 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.19 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  26 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>