More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2948 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  99.6 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  99.19 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  95.56 
 
 		 248 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  56.85 
 
 		 244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  40.91 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  44.64 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  35.74 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  35.74 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  33.98 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  30.12 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  33.33 
 
 		 292 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  37.23 
 
 		 233 aa  99.4  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  31.72 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  31.36 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  31.72 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  27.64 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  30.84 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  30.84 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  31.82 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  30.42 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  33.71 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  30.74 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  32.27 
 
 		 288 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 289 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  32.08 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  32.73 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  39.05 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0397  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0388  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  32.37 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  33.97 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 527 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  34.67 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  28.98 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 		 527 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  32.56 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  27.03 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  29.52 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2551  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6137  methyltransferase UbiE  28.79 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 519 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  37.35 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  27.94 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0292  MCP methyltransferase, CheR-type  25.59 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  24.5 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  24.83 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.82 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 624 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  26.59 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  40.48 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0093  methyltransferase type 12  34.91 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  normal  0.108853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  28.31 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3277  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  27.1 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 335 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  35.19 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  32.42 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  25.24 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  26.44 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 349 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  35.4 
 
 		 354 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 342 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  31.4 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 1162 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 284 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 257 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  30.69 
 
 		 574 aa  52.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  26.34 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0944  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase  32.03 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 328 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  33.98 
 
 		 358 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  26.4 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>