67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1368 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  98.31 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  87.76 
 
 		 237 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  87.76 
 
 		 237 aa  430  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  87.34 
 
 		 237 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  87.34 
 
 		 237 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  63.98 
 
 		 236 aa  309  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  42.26 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  31 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  32.6 
 
 		 248 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  31.72 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  31.72 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  31.72 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  35.38 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  30.86 
 
 		 318 aa  86.3  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0093  methyltransferase type 12  38.24 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  normal  0.108853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  32.46 
 
 		 244 aa  85.5  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  28.57 
 
 		 292 aa  85.9  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  31.89 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  30.86 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  29 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  27.89 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 		 527 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 		 527 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 531 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  29.44 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  27.31 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  27.53 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  30.67 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  41.67 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  33.11 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  28.27 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  27.57 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 519 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  39.77 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  40.91 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  30.22 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  27.27 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  26.02 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  25.88 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  29.19 
 
 		 240 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  29.77 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 361 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0397  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0388  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  26.32 
 
 		 2112 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5473  Methyltransferase type 12  38.81 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 239 aa  42  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3318  hypothetical protein  37.65 
 
 		 243 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>