More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3322 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  100 
 
 		 318 aa  642    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  43.25 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  39.15 
 
 		 288 aa  205  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  39.15 
 
 		 288 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  38.49 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6137  methyltransferase UbiE  27.8 
 
 		 290 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  26.98 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  30.24 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  32.99 
 
 		 240 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 242 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 255 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  30.57 
 
 		 263 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  32.81 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  32.81 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  30.42 
 
 		 248 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  32.29 
 
 		 248 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  32.81 
 
 		 244 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  30.86 
 
 		 237 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  31.35 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  30.47 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  27.06 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  37.97 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  37.14 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  29.2 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  29.2 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  29.2 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  28.26 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  31.54 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  27.24 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  28.39 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  28.74 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  28.27 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  27.44 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  26.98 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2551  Methyltransferase type 11  40.32 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 		 531 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  29.67 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 		 1162 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  32.75 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  39.56 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 527 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  33.33 
 
 		 240 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  31.17 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.58 
 
 		 213 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 269 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.86 
 
 		 282 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 238 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 710 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 239 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1423  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  24.07 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 711 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 208 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 273 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  33.88 
 
 		 262 aa  52.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  25.58 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  25.58 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  25.58 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.25 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  27.61 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  25.58 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 211 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  33.67 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  28.14 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.16 
 
 		 672 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  26.47 
 
 		 238 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  23.3 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  33 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  33 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  33 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3807  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 262 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.81 
 
 		 233 aa  50.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0093  methyltransferase type 12  37.61 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  normal  0.108853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 519 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>