67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1757 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1757  methylase  100 
 
 		 240 aa  499  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  42.68 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  43.51 
 
 		 236 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  42.68 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  42.26 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  42.26 
 
 		 237 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  42.26 
 
 		 237 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  42.26 
 
 		 237 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  31.23 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  34.01 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  34.01 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  34.01 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  33.33 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  29.22 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  33.56 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0093  methyltransferase type 12  37.6 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  normal  0.108853 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  27.83 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  24.51 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  27.19 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  24.11 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  24.4 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 531 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  23.08 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  24.77 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 		 527 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 318 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  25.78 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0388  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0397  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 		 527 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  38.03 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 519 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  27.14 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 289 aa  52  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  27.74 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  28.06 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  27.5 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  25.88 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  29.63 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  24.88 
 
 		 282 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.94 
 
 		 329 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  25.91 
 
 		 581 aa  45.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 274 aa  45.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  24.49 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  22.78 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  23.38 
 
 		 406 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  23.56 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  23.45 
 
 		 240 aa  42  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 222 aa  42  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>