240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2661 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  525  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  55.74 
 
 
274 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  34.27 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  38.32 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  38.39 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  35.65 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  37.65 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  26.42 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  31.34 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
527 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  32.56 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  32.18 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  32.49 
 
 
634 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  33.13 
 
 
531 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
527 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  32.18 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  32.18 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  38.64 
 
 
238 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
289 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  36.63 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  36.63 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  36.63 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  38.04 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  46.97 
 
 
239 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  41.67 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  35.37 
 
 
264 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  41.67 
 
 
237 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 
242 aa  58.9  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
519 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  41.3 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  35.65 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  39.58 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
248 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  39.58 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  39.58 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  50 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  30.08 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
251 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  23.48 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  35.14 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  35.9 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 
194 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  30 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2551  Methyltransferase type 11  50 
 
 
248 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  32.22 
 
 
240 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  33.33 
 
 
258 aa  52.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  29.47 
 
 
243 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  35.19 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  36.96 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 
196 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  37.68 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.03 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.5 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  32 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  34.43 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  32 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0388  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0397  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  30.56 
 
 
252 aa  49.3  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  52 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  35.51 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  46.94 
 
 
225 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 
272 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  37.68 
 
 
265 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  25.13 
 
 
207 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 
225 aa  49.3  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
235 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1562  SAM-dependent methyltransferase  36.67 
 
 
259 aa  48.9  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.595614  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  27.13 
 
 
237 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  36.61 
 
 
202 aa  48.9  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
293 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  28.21 
 
 
263 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  24.62 
 
 
207 aa  48.9  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  41.82 
 
 
237 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
710 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  27.33 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
293 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  34.44 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  36.27 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.58 
 
 
345 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  33.88 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  36.47 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
711 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>