More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0572 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  81.93 
 
 		 239 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  72.46 
 
 		 237 aa  363  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  70.34 
 
 		 237 aa  358  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  66.67 
 
 		 255 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  62.71 
 
 		 243 aa  319  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  62.23 
 
 		 289 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  59.24 
 
 		 241 aa  310  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  60.59 
 
 		 241 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  58.9 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  59.32 
 
 		 237 aa  304  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  61.7 
 
 		 243 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  61.7 
 
 		 243 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  61.7 
 
 		 243 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  54.62 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  57.61 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  48.31 
 
 		 238 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  49.38 
 
 		 240 aa  211  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  41.25 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  42.37 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  43.04 
 
 		 239 aa  194  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  43.56 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  26.89 
 
 		 276 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  27.66 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  27.2 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  26.05 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  42.37 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  35 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  34.1 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  33.75 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  55.56 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  32.69 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.45 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.15 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  23.32 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  37.5 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  21.91 
 
 		 294 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.11 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 		 276 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.67 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.61 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 203 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.6 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.51 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  37.19 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  29.88 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  35.95 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  35.95 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.26 
 
 		 345 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  32.7 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.7 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  25 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  29.53 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  34.82 
 
 		 710 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  34.13 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  35.95 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.29 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2558  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  27.51 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.64 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  32.92 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  25.33 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 637 aa  62.8  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  32.73 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.63 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.05 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 266 aa  62  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.25 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.63 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 		 711 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  34.64 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  32.58 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  31.78 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>