More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0358 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  100 
 
 		 637 aa  1311    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  70.71 
 
 		 663 aa  933    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2222  hypothetical protein  45.22 
 
 		 354 aa  296  7e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1724  hypothetical protein  39.18 
 
 		 343 aa  239  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.92014  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1501  hypothetical protein  38.97 
 
 		 348 aa  220  7e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  38.83 
 
 		 638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  40.71 
 
 		 259 aa  198  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1551  D-alanine--D-alanine ligase  36.31 
 
 		 344 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0372534 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_570  D-alanine--D-alanine ligase  33.83 
 
 		 338 aa  160  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0629  D-ala D-ala ligase  36.69 
 
 		 338 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0602  D-alanine--D-alanine ligase  35.94 
 
 		 338 aa  152  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0135  D-alanine--D-alanine ligase  33.01 
 
 		 336 aa  150  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2749  D-alanine--D-alanine ligase  32.33 
 
 		 338 aa  146  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0081  D-alanine--D-alanine ligase  37.5 
 
 		 310 aa  145  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.201322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1410  D-alanine--D-alanine ligase  33.75 
 
 		 728 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.801372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1506  D-alanine--D-alanine ligase  33.12 
 
 		 728 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.736453  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  34.59 
 
 		 743 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  32.96 
 
 		 347 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2449  D-alanine--D-alanine ligase  33.54 
 
 		 727 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1418  D-alanine--D-alanine ligase  33.02 
 
 		 731 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2162  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  32.2 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0712  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  30.03 
 
 		 326 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.396337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3042  D-alanine--D-alanine ligase  31.43 
 
 		 349 aa  125  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1784  D-alanine--D-alanine ligase  31.5 
 
 		 325 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  30.16 
 
 		 308 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  30.16 
 
 		 308 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  35.74 
 
 		 252 aa  115  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1775  D-alanine--D-alanine ligase domain protein  29.06 
 
 		 331 aa  115  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.286204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  30.8 
 
 		 336 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 261 aa  114  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  32.73 
 
 		 253 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 262 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  29.01 
 
 		 318 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 251 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  34.17 
 
 		 259 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  31.85 
 
 		 308 aa  110  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  31.75 
 
 		 304 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  31.75 
 
 		 304 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  31.75 
 
 		 304 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  31.75 
 
 		 304 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 250 aa  107  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  29.93 
 
 		 311 aa  107  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 675 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  30.5 
 
 		 304 aa  107  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  29.18 
 
 		 308 aa  107  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  30.5 
 
 		 304 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5793  D-alanine--D-lactate ligase  31.69 
 
 		 346 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 271 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  30.31 
 
 		 316 aa  105  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  31.35 
 
 		 304 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  30.95 
 
 		 304 aa  104  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7137  D-alanine--D-lactate ligase  32.1 
 
 		 348 aa  104  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  30.95 
 
 		 304 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1414  D-alanine/D-alanine ligase  32 
 
 		 346 aa  104  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  27.96 
 
 		 299 aa  104  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  32 
 
 		 314 aa  103  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  29.7 
 
 		 308 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  29.21 
 
 		 312 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  35.18 
 
 		 262 aa  101  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1664  D-alanine--D-lactate ligase  28.94 
 
 		 341 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  29.02 
 
 		 342 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  28.11 
 
 		 313 aa  100  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  28.31 
 
 		 350 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  29.35 
 
 		 305 aa  100  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  28.33 
 
 		 303 aa  100  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 252 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  26.77 
 
 		 364 aa  99.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  29.74 
 
 		 311 aa  98.6  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  30.38 
 
 		 309 aa  98.2  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5946  D-alanyl-alanine synthetase A  29.21 
 
 		 329 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.588243  normal  0.0506502 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  28.34 
 
 		 303 aa  97.8  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  28.78 
 
 		 346 aa  97.4  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  31.37 
 
 		 305 aa  96.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  29.49 
 
 		 305 aa  96.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  30.14 
 
 		 313 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  28.57 
 
 		 334 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  28.91 
 
 		 310 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  27.96 
 
 		 310 aa  96.3  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  29.62 
 
 		 327 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  28.19 
 
 		 314 aa  95.5  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  28.77 
 
 		 318 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  28.53 
 
 		 306 aa  95.5  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  29.13 
 
 		 306 aa  95.1  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5356  D-alanine/D-alanine ligase  27.72 
 
 		 346 aa  94.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315218  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  26.8 
 
 		 338 aa  94.7  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  30.9 
 
 		 249 aa  95.1  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  29.79 
 
 		 318 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  28.77 
 
 		 318 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  30.63 
 
 		 319 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  27.54 
 
 		 383 aa  94.7  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  30.5 
 
 		 306 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  30.5 
 
 		 306 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  30.5 
 
 		 306 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1891  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 		 527 aa  94.4  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  30.5 
 
 		 306 aa  94  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  30.27 
 
 		 306 aa  94  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  28.62 
 
 		 376 aa  94  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  29.78 
 
 		 324 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  30.12 
 
 		 306 aa  93.6  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  28.08 
 
 		 318 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>